More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0072 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0072  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  100 
 
 		 368 aa  730    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.152477  normal  0.89732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2807  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  76.73 
 
 		 373 aa  569  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1581  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  77.32 
 
 		 373 aa  567  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.316874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3959  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  57.18 
 
 		 372 aa  351  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100103 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11150  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  47.98 
 
 		 398 aa  295  7e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0840629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3292  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  47.31 
 
 		 359 aa  293  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.813307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  45.95 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2290  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  48.67 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.340789  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1681  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  44.99 
 
 		 400 aa  273  3e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  hitchhiker  0.00595752 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1362  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  48.79 
 
 		 406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0844  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.01 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  42.67 
 
 		 381 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2311  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  45.83 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.110307  hitchhiker  0.00307802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0718  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  42.59 
 
 		 394 aa  256  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1876  Cystathionine gamma-lyase  40.69 
 
 		 371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  40.75 
 
 		 378 aa  246  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  42.86 
 
 		 388 aa  246  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  42.82 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  43.02 
 
 		 392 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  43.02 
 
 		 392 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  43.02 
 
 		 392 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  43.54 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  41.14 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  42.04 
 
 		 390 aa  239  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  43.35 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  43.15 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  38.48 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.56 
 
 		 387 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  40.95 
 
 		 387 aa  236  6e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.56 
 
 		 387 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.83 
 
 		 387 aa  235  9e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  38.79 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.28 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  42.26 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  35.92 
 
 		 380 aa  233  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  39.5 
 
 		 390 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  41.72 
 
 		 376 aa  232  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  38.74 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  37.36 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  36.94 
 
 		 379 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  40 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  40.28 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40 
 
 		 389 aa  230  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  40 
 
 		 393 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  38.94 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  38.94 
 
 		 390 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  41.92 
 
 		 379 aa  229  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  42.9 
 
 		 397 aa  229  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  38.1 
 
 		 379 aa  229  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0673  hypothetical protein  40.62 
 
 		 374 aa  228  9e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000849749 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  39.88 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.39 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  38.87 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  40.67 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.72 
 
 		 387 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  38.96 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  39.39 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  39.72 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  38.42 
 
 		 386 aa  226  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  44.68 
 
 		 380 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.15 
 
 		 388 aa  226  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  40.06 
 
 		 393 aa  226  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  39.44 
 
 		 386 aa  226  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  40.88 
 
 		 386 aa  226  6e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  39.84 
 
 		 390 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  40.64 
 
 		 400 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.35 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  41.09 
 
 		 393 aa  224  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.95 
 
 		 394 aa  223  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  42.64 
 
 		 394 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  42.94 
 
 		 394 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  39.09 
 
 		 381 aa  222  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  39.07 
 
 		 389 aa  222  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1495  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.7 
 
 		 361 aa  222  8e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0842973  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  38.26 
 
 		 378 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  37.93 
 
 		 378 aa  222  9e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.72 
 
 		 388 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  40.96 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  40.77 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  36.94 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  36.59 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  40.3 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  39.3 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.41 
 
 		 390 aa  220  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  42.26 
 
 		 383 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  38.28 
 
 		 379 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  41.98 
 
 		 380 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  36.68 
 
 		 380 aa  219  7e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  38.83 
 
 		 390 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  41.14 
 
 		 392 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  41.85 
 
 		 400 aa  219  8.999999999999998e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.5 
 
 		 422 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  41.74 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  39.94 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  38.95 
 
 		 405 aa  217  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  41.59 
 
 		 380 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  37.95 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  38.66 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1425  cystathionine gamma-lyase  44.29 
 
 		 400 aa  216  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.144406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>