More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1684 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1684  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  100 
 
 
410 aa  790    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1158  cystathionine gamma-lyase  54.25 
 
 
373 aa  319  5e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0760832  unclonable  0.0000000519282 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1425  cystathionine gamma-lyase  50.94 
 
 
400 aa  309  5e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.144406  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1267  cystathionine gamma-lyase  54.42 
 
 
371 aa  302  9e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.929061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5997  cystathionine gamma-lyase  49.49 
 
 
375 aa  282  8.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.847567  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4220  cystathionine gamma-lyase  47.35 
 
 
369 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2142  cystathionine gamma-lyase  46.84 
 
 
369 aa  275  7e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.654295  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1928  cystathionine gamma-lyase  46.92 
 
 
367 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1974  cystathionine gamma-lyase  46.92 
 
 
367 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1908  cystathionine gamma-lyase  46.65 
 
 
367 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22690  cystathionine gamma-lyase  47.21 
 
 
392 aa  263  4.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  49.73 
 
 
379 aa  252  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1362  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  45.38 
 
 
406 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0844  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  40.31 
 
 
396 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1581  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.15 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.316874  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0718  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  40.82 
 
 
394 aa  216  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  38.99 
 
 
387 aa  216  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2290  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.01 
 
 
378 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.340789  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  35.05 
 
 
379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  38.07 
 
 
405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1681  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  39.9 
 
 
400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  hitchhiker  0.00595752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  35.93 
 
 
398 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  38.38 
 
 
383 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  42.94 
 
 
377 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  36.09 
 
 
398 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  39.56 
 
 
390 aa  210  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  38.22 
 
 
379 aa  210  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  41.67 
 
 
401 aa  209  7e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  37.94 
 
 
418 aa  209  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0072  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.27 
 
 
368 aa  208  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.152477  normal  0.89732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  38.08 
 
 
389 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  35.07 
 
 
398 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2807  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.33 
 
 
373 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70481  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  38.97 
 
 
402 aa  207  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  36.06 
 
 
387 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2311  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.33 
 
 
391 aa  206  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.110307  hitchhiker  0.00307802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  43.23 
 
 
390 aa  206  8e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  35.13 
 
 
381 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  32.91 
 
 
401 aa  205  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  37.78 
 
 
394 aa  205  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  34.68 
 
 
390 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  38.33 
 
 
377 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  40.34 
 
 
423 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  37.47 
 
 
379 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  40.34 
 
 
423 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  35.43 
 
 
397 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  36.43 
 
 
381 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  35.55 
 
 
387 aa  202  8e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  38.04 
 
 
392 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11150  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  40.53 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0840629  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  36.19 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  38.11 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  38.69 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  38.54 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  37.15 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  38.36 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  37.43 
 
 
392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  36.29 
 
 
392 aa  200  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  35.67 
 
 
399 aa  201  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  38.56 
 
 
387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  33.77 
 
 
379 aa  199  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  35.47 
 
 
397 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  37.66 
 
 
386 aa  199  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  38.15 
 
 
395 aa  199  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  37.4 
 
 
387 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  38.4 
 
 
389 aa  199  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  39.08 
 
 
378 aa  199  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  32.7 
 
 
379 aa  199  9e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  37.74 
 
 
388 aa  199  9e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  37.34 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  38.92 
 
 
394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  34.45 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  35.86 
 
 
380 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  37.31 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  36.13 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  35.47 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3959  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  44.3 
 
 
372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.100103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  37.66 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  34.23 
 
 
386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  37.85 
 
 
390 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  34.29 
 
 
393 aa  197  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  38.26 
 
 
380 aa  197  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  34.2 
 
 
385 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1948  Cystathionine gamma-synthase  37.72 
 
 
398 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3857  cystathionine gamma-synthase  39.43 
 
 
378 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0318176  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  36.53 
 
 
390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0316  cystathionine gamma-synthase  38.68 
 
 
410 aa  196  6e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  38.46 
 
 
399 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  34.88 
 
 
397 aa  195  9e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  36.5 
 
 
390 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  35.16 
 
 
397 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  37.22 
 
 
394 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  36.72 
 
 
400 aa  195  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  32.82 
 
 
392 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  36.62 
 
 
425 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  33.71 
 
 
392 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  34.59 
 
 
397 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  35.99 
 
 
398 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  35.66 
 
 
377 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1495  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  41.96 
 
 
361 aa  194  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0842973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>