More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5997 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5997  cystathionine gamma-lyase  100 
 
 		 375 aa  726    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.847567  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1158  cystathionine gamma-lyase  58.76 
 
 		 373 aa  361  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0760832  unclonable  0.0000000519282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1267  cystathionine gamma-lyase  59.56 
 
 		 371 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.929061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1425  cystathionine gamma-lyase  55.8 
 
 		 400 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.144406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1928  cystathionine gamma-lyase  52.89 
 
 		 367 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1974  cystathionine gamma-lyase  52.89 
 
 		 367 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1908  cystathionine gamma-lyase  52.62 
 
 		 367 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4220  cystathionine gamma-lyase  51.66 
 
 		 369 aa  330  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2142  cystathionine gamma-lyase  51.64 
 
 		 369 aa  324  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.654295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  56.35 
 
 		 379 aa  316  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22690  cystathionine gamma-lyase  49.33 
 
 		 392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1684  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  50.26 
 
 		 410 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  43.98 
 
 		 381 aa  233  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0844  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.44 
 
 		 396 aa  229  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11150  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  46.53 
 
 		 398 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0840629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  45.99 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  43.11 
 
 		 392 aa  225  9e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  42.34 
 
 		 390 aa  222  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2290  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  46.39 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.340789  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  42.56 
 
 		 387 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1362  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  47.26 
 
 		 406 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  42.34 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  42.81 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  41.16 
 
 		 393 aa  219  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2311  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  47.25 
 
 		 391 aa  217  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.110307  hitchhiker  0.00307802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  41.64 
 
 		 387 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  42.48 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  42.82 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0718  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  43.99 
 
 		 394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  42.69 
 
 		 383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3292  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  42.94 
 
 		 359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.813307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0072  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.17 
 
 		 368 aa  212  7.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.152477  normal  0.89732 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1581  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.03 
 
 		 373 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.316874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  39.82 
 
 		 383 aa  209  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  41.09 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  41.09 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  37.57 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  40.96 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  43.16 
 
 		 372 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  41.59 
 
 		 387 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  41.59 
 
 		 390 aa  206  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  38.37 
 
 		 394 aa  206  8e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  44.31 
 
 		 385 aa  205  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  38.14 
 
 		 389 aa  205  9e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  40.36 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  40.48 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  40.36 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  39.82 
 
 		 400 aa  202  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  38.58 
 
 		 392 aa  202  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  39.55 
 
 		 381 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  40.06 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  40.42 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  35.21 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  41.14 
 
 		 384 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  38.51 
 
 		 387 aa  199  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  38.64 
 
 		 373 aa  199  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  39.82 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  38.74 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  37.76 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  39.64 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  39.64 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  39.64 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1681  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  40.43 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  hitchhiker  0.00595752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  33.43 
 
 		 392 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20810  cystathionine gamma-lyase  44.01 
 
 		 434 aa  196  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  40.71 
 
 		 394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  39.36 
 
 		 393 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  41.12 
 
 		 381 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  42.68 
 
 		 380 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  38.41 
 
 		 376 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  36.53 
 
 		 380 aa  196  5.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  41 
 
 		 394 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  42.34 
 
 		 401 aa  195  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  40.48 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2807  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  38.62 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70481  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  33.95 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  39.94 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  39.18 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  39.88 
 
 		 380 aa  193  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  33.51 
 
 		 386 aa  194  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  33.43 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.4 
 
 		 388 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  40.36 
 
 		 394 aa  191  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  35.76 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  39.45 
 
 		 423 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38 
 
 		 388 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  39.45 
 
 		 423 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1876  Cystathionine gamma-lyase  36.94 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  39.64 
 
 		 388 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3959  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  45.24 
 
 		 372 aa  189  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100103 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04601  putative cystathionine gamma-synthase  33.6 
 
 		 389 aa  189  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  39.24 
 
 		 390 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  37.46 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  37.46 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  35.31 
 
 		 390 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  39.3 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  33.62 
 
 		 392 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4016  cystathionine gamma-synthase  40.48 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.683871  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1743  putative cystathionine gamma-synthase  33.42 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  36.28 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>