More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0408 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 
128 aa  253  9e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  63.49 
 
 
132 aa  159  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  60.66 
 
 
126 aa  158  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  51.61 
 
 
134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  46.83 
 
 
131 aa  113  7.999999999999999e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  41.09 
 
 
130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  42.19 
 
 
132 aa  107  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  42.15 
 
 
136 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  40.31 
 
 
132 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  41.09 
 
 
132 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  46.51 
 
 
132 aa  105  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  44.96 
 
 
132 aa  104  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  40.77 
 
 
132 aa  104  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  41.27 
 
 
131 aa  102  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  46.03 
 
 
132 aa  100  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  34.92 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  41.22 
 
 
133 aa  99.4  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  41.09 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  44.53 
 
 
131 aa  99.4  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  45.3 
 
 
132 aa  99  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  40.8 
 
 
129 aa  98.6  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  42.02 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  39.06 
 
 
132 aa  98.2  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  40.32 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  44.35 
 
 
133 aa  97.8  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  46.15 
 
 
161 aa  97.8  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  40.62 
 
 
133 aa  97.4  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  38.21 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  39.32 
 
 
136 aa  97.1  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  40.8 
 
 
137 aa  97.1  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  39.23 
 
 
133 aa  96.7  9e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  37.5 
 
 
132 aa  96.3  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  41.86 
 
 
132 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  37.9 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  41.6 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  34.11 
 
 
132 aa  94  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  40.62 
 
 
131 aa  94  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  40.31 
 
 
132 aa  93.6  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  40.62 
 
 
141 aa  93.6  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  36.92 
 
 
132 aa  93.2  9e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  42.4 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  39.06 
 
 
133 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  40.94 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  35.66 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  39.53 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  41.35 
 
 
141 aa  92  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  40.8 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  41.6 
 
 
130 aa  91.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  38.35 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  41.6 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  37.8 
 
 
134 aa  90.9  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  36.43 
 
 
132 aa  90.5  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  41.94 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  38.28 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  38.97 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  38.76 
 
 
132 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  39.06 
 
 
143 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  39.02 
 
 
131 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  38.14 
 
 
137 aa  88.6  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  39.68 
 
 
138 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  42.11 
 
 
137 aa  87.4  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  41.88 
 
 
140 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  39.84 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3497  hypothetical protein  63.16 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0304537  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  39.68 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  44.17 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  39.53 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  37.5 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  43.31 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  37.4 
 
 
133 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  40 
 
 
141 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  35.2 
 
 
132 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  42.75 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  42.31 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  38.4 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  33.82 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  39.84 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  36.64 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  36 
 
 
130 aa  82  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  40.98 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  41.18 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  39.32 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  42.98 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  38.4 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  40 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  33.6 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  32.8 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  34.13 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  32.28 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  44.74 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40920  predicted protein  35.07 
 
 
184 aa  77  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  32.54 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  29.13 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  32.8 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1344  hypothetical protein  32.28 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2106  hypothetical protein  31.5 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  39.23 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  30.83 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0515  protein of unknown function UPF0047  29.01 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0221734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  32.81 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>