212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3497 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3497  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  279  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0304537  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  63.16 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  48 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  37.14 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  37.38 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  35.85 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  44.62 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  32.2 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  38.61 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  47.76 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  54.39 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  47.76 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  58 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  67  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  57.69 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  38.16 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  50.85 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  38.14 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  52.31 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  47.69 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  41.27 
 
 		 584 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  48.39 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  52.54 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  57.69 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0515  protein of unknown function UPF0047  34.88 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0221734  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  48.33 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  45.16 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2359  protein of unknown function UPF0047  34.88 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  54.35 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  46.67 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  30.23 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2106  hypothetical protein  29.77 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  43.08 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  47.37 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2631  hypothetical protein  39.68 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1685  hypothetical protein  35.63 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  48.15 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1344  hypothetical protein  31.01 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3409  hypothetical protein  34.48 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000525529  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3144  hypothetical protein  34.48 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  48.21 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  38.1 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1739  protein of unknown function UPF0047  34.88 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40920  predicted protein  49.02 
 
 		 184 aa  60.5  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  34.09 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  48.33 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  47.69 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  57.78 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  40.98 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  41.94 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  49.06 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2109  protein of unknown function UPF0047  34.21 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0609464 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  46.67 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  48.15 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3284  protein of unknown function UPF0047  36.51 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22360  hypothetical protein  33.72 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  34.92 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  57.78 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0976  protein of unknown function UPF0047  36.51 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.394936  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  37.5 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  49.06 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  47.27 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1065  hypothetical protein  38.1 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00346486  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  49.06 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  50.98 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  42.59 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  28.12 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  50.98 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  46.55 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  47.17 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  46.55 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  43.08 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  41.94 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3072  hypothetical protein  37.1 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  45 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  47.06 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  54.55 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39455  predicted protein  48 
 
 		 244 aa  57.4  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  47.06 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  42.59 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2329  hypothetical protein  32.18 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561757  normal  0.383888 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  35.48 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  46.3 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3634  protein of unknown function UPF0047  29.89 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  38.96 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  40.38 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  43.33 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1191  hypothetical protein  34.38 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  44.23 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  45.16 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2666  protein of unknown function UPF0047  36.51 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  43.94 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  53.06 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  41.94 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  38.1 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.666502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>