More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1050 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 		 136 aa  269  9e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  62.22 
 
 		 137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  59.26 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  58.33 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  48.84 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  49.63 
 
 		 139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1088  protein of unknown function UPF0047  42.42 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.977912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  48.06 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  37.59 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  39.1 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  34.85 
 
 		 137 aa  86.7  9e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  32.84 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  31.85 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  32.03 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  34.81 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  29.37 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  33.59 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  37.5 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  30.23 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  30.95 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  34.68 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  34.11 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  32.09 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  33.58 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  34.38 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  31.97 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  35.54 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  36.03 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1410  hypothetical protein  32.35 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  32.33 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  36.15 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  35.11 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  31.62 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  39.23 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  28.57 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  34.68 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  30.08 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  31.34 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  26.87 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  32.59 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  33.09 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  32.35 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  30.3 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  30.65 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  31.5 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  35.38 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  36.64 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  33.05 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  32.31 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  29.41 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  34.4 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  36.43 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  30.71 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08050  UPF0047 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G02090)  36.23 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.823848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  36.8 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40920  predicted protein  34.67 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  29.13 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  30.23 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  33.82 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2329  hypothetical protein  31.62 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561757  normal  0.383888 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  30.3 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  36.57 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12577  hypothetical protein  40.17 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0908128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  33.87 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  37.29 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2363  hypothetical protein  30.88 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100491  normal  0.704799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  31.2 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  28.57 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  33.61 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  33.08 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  29.23 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  36.29 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  26.12 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0254  protein of unknown function UPF0047  33.88 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  26.12 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  29.23 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  27.56 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1152  hypothetical protein  29.41 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  28.03 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1191  hypothetical protein  28.68 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  26.12 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  28.68 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  33.04 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  32.23 
 
 		 141 aa  67  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  29.1 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  28.36 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  30.33 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1152  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  hitchhiker  0.00000047058 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  30.53 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3764  hypothetical protein  35.34 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.434678 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  31.58 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  24.63 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  31.45 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  32.26 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  31.54 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0539  protein of unknown function UPF0047  34.85 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>