More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0620 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 		 132 aa  272  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  97.73 
 
 		 132 aa  268  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  59.09 
 
 		 133 aa  187  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  58.33 
 
 		 133 aa  174  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  58.91 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  51.91 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  49.23 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  50.39 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  51.13 
 
 		 132 aa  150  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  45.04 
 
 		 143 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  52.34 
 
 		 138 aa  147  7e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  47.69 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  51.15 
 
 		 138 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  51.56 
 
 		 152 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  44.96 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  48.46 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  46.92 
 
 		 132 aa  141  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  46.21 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  48.84 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  46.21 
 
 		 132 aa  139  9e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  44.7 
 
 		 132 aa  139  9e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  45.45 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  50.77 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  48.84 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  44.62 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  52.85 
 
 		 133 aa  137  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  48.84 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  50.78 
 
 		 133 aa  135  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  48.78 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  47.69 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  50.39 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  45.8 
 
 		 133 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  48.48 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  50.39 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  47.11 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  44.7 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  52.89 
 
 		 132 aa  130  7.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  46.09 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  46.51 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  46.09 
 
 		 131 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  42.75 
 
 		 131 aa  126  8.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  39.53 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  124  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  47.73 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  45.97 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  47.5 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  40.8 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  40.8 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  45.24 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  45.67 
 
 		 136 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  44.88 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  40 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  43.18 
 
 		 138 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  35.88 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  43.31 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  40.74 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  41.73 
 
 		 130 aa  97.1  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  36.64 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  36.96 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  36.96 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  39.71 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  40.31 
 
 		 128 aa  93.6  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  37.4 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  38.02 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  34.78 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  38.33 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  38.71 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  38.06 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  35.38 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  35.77 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  34.09 
 
 		 138 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  39.34 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  38.81 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  33.83 
 
 		 138 aa  87.8  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  36.76 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  30.3 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  35.82 
 
 		 161 aa  87.8  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  36.96 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  35.88 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  34.09 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  36.76 
 
 		 140 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32835  conserved hypothetical protein  34.09 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.805601  normal  0.755477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  34.31 
 
 		 137 aa  87  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0261  hypothetical protein  38.35 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  34.78 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  37.69 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  35.04 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  38.97 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1691  hypothetical protein  39.84 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00156174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1152  protein of unknown function UPF0047  37.23 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  hitchhiker  0.00000047058 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  39.2 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1335  hypothetical protein  35.29 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970106  decreased coverage  0.00476745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1039  protein of unknown function UPF0047  46.67 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  36.76 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  35.71 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  34.56 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  36.69 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>