More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2260 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 
130 aa  269  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  52.34 
 
 
132 aa  146  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  51.56 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  50 
 
 
129 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  55.93 
 
 
131 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  49.21 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  46.88 
 
 
132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  46.92 
 
 
139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  48.06 
 
 
132 aa  127  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  47.58 
 
 
133 aa  126  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  48.33 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  46.15 
 
 
136 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  48.03 
 
 
143 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  47.2 
 
 
130 aa  122  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  48 
 
 
131 aa  123  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  50.82 
 
 
132 aa  122  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  47.2 
 
 
133 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  47.11 
 
 
132 aa  122  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  45.38 
 
 
139 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  43.31 
 
 
132 aa  121  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  43.31 
 
 
131 aa  120  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  49.17 
 
 
132 aa  120  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  46.51 
 
 
132 aa  120  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  45.45 
 
 
143 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  47.5 
 
 
132 aa  120  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  45.69 
 
 
132 aa  120  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  43.75 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  47.29 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  47.5 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  47.97 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  47.15 
 
 
134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  46.03 
 
 
152 aa  118  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  43.51 
 
 
138 aa  117  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  43.41 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  43.22 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  43.33 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  42.64 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  40.94 
 
 
132 aa  114  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  44.19 
 
 
138 aa  114  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  44.19 
 
 
138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  45 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  42.37 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  40.48 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  48.84 
 
 
131 aa  110  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  39.06 
 
 
133 aa  110  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  40.94 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  39.53 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  43.55 
 
 
133 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  39.84 
 
 
134 aa  107  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  43.18 
 
 
132 aa  106  9.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  41.41 
 
 
134 aa  106  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  39.06 
 
 
132 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  40.68 
 
 
133 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  43.59 
 
 
135 aa  103  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  43.59 
 
 
135 aa  103  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  35.43 
 
 
133 aa  102  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  39.5 
 
 
130 aa  98.6  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  49.02 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  36.67 
 
 
130 aa  94.4  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  41.46 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  35.94 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03880  conserved hypothetical protein  46.09 
 
 
140 aa  84.7  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  34.59 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  36.67 
 
 
157 aa  84.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  34.11 
 
 
143 aa  84.3  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  38.1 
 
 
160 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  40.18 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  36.51 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  46.46 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  36.44 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  37.1 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  31.45 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  31.58 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  41.18 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.04 
 
 
584 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  38.71 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1039  protein of unknown function UPF0047  45.98 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  38.33 
 
 
160 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  45.36 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  36.67 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32835  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.805601  normal  0.755477 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2351  hypothetical protein  46.39 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0140381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  45.92 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  33.59 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  30.33 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1893  hypothetical protein  43.3 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.323991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  43.3 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  38.02 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  40.59 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  48.31 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  38.02 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  38.02 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3367  hypothetical protein  38.02 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00750068  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08050  UPF0047 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G02090)  31.75 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.823848  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2631  hypothetical protein  33.87 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0559  hypothetical protein  42.86 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  37.82 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4360  hypothetical protein  40.16 
 
 
139 aa  77  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2359  protein of unknown function UPF0047  32.26 
 
 
138 aa  77  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  32 
 
 
137 aa  77  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>