More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3175 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  278  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  64.62 
 
 		 131 aa  191  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  61.07 
 
 		 131 aa  183  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  53.03 
 
 		 132 aa  163  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  53.49 
 
 		 131 aa  160  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  52.71 
 
 		 133 aa  158  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  56.91 
 
 		 152 aa  158  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  54.81 
 
 		 138 aa  157  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  50.39 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  52.38 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  48.06 
 
 		 132 aa  149  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  48.41 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  48.44 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  49.21 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  52.94 
 
 		 131 aa  144  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  47.2 
 
 		 130 aa  143  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  47.66 
 
 		 132 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  47.62 
 
 		 132 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  49.22 
 
 		 133 aa  143  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  48.09 
 
 		 133 aa  140  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  51.2 
 
 		 131 aa  141  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  46.92 
 
 		 132 aa  139  9e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  48.84 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  52.67 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  46.92 
 
 		 133 aa  137  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  46.34 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  52.67 
 
 		 139 aa  136  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  45.38 
 
 		 131 aa  137  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  48.09 
 
 		 131 aa  137  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  47.62 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  45.24 
 
 		 138 aa  135  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  48.78 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  52 
 
 		 133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  45.74 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  44.19 
 
 		 133 aa  134  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  46.4 
 
 		 133 aa  133  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  46.46 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  51.54 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  42.86 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  45.67 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  45.67 
 
 		 135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  49.61 
 
 		 134 aa  130  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  47.97 
 
 		 132 aa  130  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  47.62 
 
 		 134 aa  130  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  48.51 
 
 		 132 aa  130  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  41.41 
 
 		 143 aa  129  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  46.27 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  43.51 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  43.08 
 
 		 133 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  42.52 
 
 		 143 aa  123  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  41.86 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  41.27 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  42.28 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  41.94 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  40.94 
 
 		 130 aa  114  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  39.2 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  37.21 
 
 		 134 aa  93.6  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  41.27 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  36.72 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  34.4 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  36.89 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  33.83 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  34.85 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  36.72 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  35.59 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  32.12 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  34.38 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  40 
 
 		 160 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  35.2 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  39.05 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  36.72 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  34.15 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  42.57 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  35.11 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  35.71 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  32.76 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  33.59 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  76.6  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  36.52 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  31.9 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  30.71 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  31.5 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  37.5 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  33.59 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  44.94 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  31.82 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  29.46 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  30.88 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  36.79 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  33.05 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  33.05 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  35.38 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  29.32 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0261  hypothetical protein  43.82 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  36.36 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>