More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0454 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  93.94 
 
 
132 aa  261  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  88.64 
 
 
132 aa  248  3e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  74.81 
 
 
132 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  57.25 
 
 
132 aa  174  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  54.55 
 
 
132 aa  167  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  48.85 
 
 
132 aa  163  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  51.15 
 
 
132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  56.59 
 
 
130 aa  158  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  54.62 
 
 
132 aa  156  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  55.2 
 
 
129 aa  155  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  42.19 
 
 
133 aa  153  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  48.85 
 
 
132 aa  151  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  44.96 
 
 
132 aa  151  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  51.94 
 
 
130 aa  152  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  50.38 
 
 
133 aa  150  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  52.42 
 
 
152 aa  149  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  51.97 
 
 
133 aa  147  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  47.73 
 
 
133 aa  146  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  48.09 
 
 
133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  48 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  48.46 
 
 
133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  47.2 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  47.62 
 
 
132 aa  143  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  47.29 
 
 
131 aa  142  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  48.76 
 
 
131 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  50.38 
 
 
135 aa  140  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  50.38 
 
 
135 aa  140  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  45.45 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  50.41 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  45.45 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  48.85 
 
 
132 aa  138  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  44.88 
 
 
133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  45.8 
 
 
138 aa  137  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  44.7 
 
 
132 aa  137  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  43.94 
 
 
134 aa  135  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  45.38 
 
 
143 aa  135  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  45.6 
 
 
130 aa  136  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  50 
 
 
131 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  46.88 
 
 
133 aa  135  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  44.62 
 
 
132 aa  135  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  52.42 
 
 
132 aa  134  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  40.94 
 
 
131 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  45.04 
 
 
138 aa  133  8e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  47.2 
 
 
131 aa  133  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  41.35 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  42.86 
 
 
136 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  43.51 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  41.13 
 
 
134 aa  127  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  42.97 
 
 
134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  44.27 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  44.53 
 
 
139 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  45.04 
 
 
133 aa  123  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  42.97 
 
 
136 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  41.41 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  42.37 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  42.62 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  40.31 
 
 
128 aa  106  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  41.54 
 
 
128 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  35.43 
 
 
132 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  35.88 
 
 
132 aa  100  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  42.02 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  35.16 
 
 
134 aa  99  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  37.88 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1893  hypothetical protein  50 
 
 
139 aa  98.2  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.323991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  42.14 
 
 
139 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  46.02 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  35.11 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  44.26 
 
 
139 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  42.98 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  38.71 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  42.62 
 
 
139 aa  94  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  41.35 
 
 
141 aa  90.9  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  34.13 
 
 
126 aa  90.5  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  39.34 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  36.03 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  36.09 
 
 
144 aa  89.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  40.83 
 
 
145 aa  89.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  34.09 
 
 
131 aa  88.6  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  35.11 
 
 
138 aa  87.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0261  hypothetical protein  43.48 
 
 
141 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  35.16 
 
 
137 aa  86.7  9e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  33.58 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  31.78 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  32.35 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  42.16 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  44.66 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  34.71 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1039  protein of unknown function UPF0047  39.42 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0493  hypothetical protein  36.44 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0896666  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05191  hypothetical protein  36.44 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0327196  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05561  hypothetical protein  37.29 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  34.59 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  35.71 
 
 
136 aa  82  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  41.12 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1344  hypothetical protein  32.82 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  33.08 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2351  hypothetical protein  40.38 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0140381  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1293  hypothetical protein  34.09 
 
 
140 aa  82  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  39.22 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0564298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>