More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1417 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  291  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  71.63 
 
 		 141 aa  226  8e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  66.43 
 
 		 141 aa  210  4.9999999999999996e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  63.12 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  62.41 
 
 		 148 aa  197  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  64.71 
 
 		 141 aa  196  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  66.67 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  55.71 
 
 		 160 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  55.71 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  57.86 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  54.29 
 
 		 142 aa  173  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  48.28 
 
 		 145 aa  136  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  44.14 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  43.45 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  37.14 
 
 		 143 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40920  predicted protein  38.3 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  39.39 
 
 		 134 aa  100  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  35 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  35 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39455  predicted protein  34.71 
 
 		 244 aa  95.1  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  42.4 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  40.62 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  35.11 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  34.11 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  32.61 
 
 		 138 aa  90.1  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  38.4 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  33.82 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  35.46 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  34.33 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  32.12 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  35.51 
 
 		 132 aa  86.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  34.78 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  33.57 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05951  hypothetical protein  32.82 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.517381 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  34.09 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  36.8 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  33.08 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  32.14 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 131 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  32.35 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  37.61 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  30.16 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  34.35 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  32.37 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  31.34 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  34.06 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  30.53 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  34.07 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  32.09 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  36.8 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  31.82 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  32.09 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  34.15 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  30.08 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  34.51 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  29.85 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  32.09 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  32.39 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  31.91 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2329  hypothetical protein  34.04 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561757  normal  0.383888 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  32.61 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  31.16 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  33.07 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  34.51 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  32.39 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  32.56 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  32.65 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  30.43 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  31.65 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2666  protein of unknown function UPF0047  35.56 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  29.85 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  35.34 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  31.03 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  32.17 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  30.6 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  27.86 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  31.2 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  31.25 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2106  hypothetical protein  34.51 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  33.09 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  33.1 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  30.94 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  36.29 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  30.4 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3144  hypothetical protein  33.8 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1445  hypothetical protein  34.04 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0875053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3409  hypothetical protein  33.1 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000525529  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  28.8 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2363  hypothetical protein  33.1 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100491  normal  0.704799 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0111  hypothetical protein  33.8 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000308533 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  34.51 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  33.06 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3230  hypothetical protein  35.07 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0632  hypothetical protein  32.79 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1344  hypothetical protein  35.92 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>