More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0528 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 
146 aa  297  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  70.83 
 
 
145 aa  218  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  65.97 
 
 
145 aa  204  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  61.81 
 
 
145 aa  184  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40920  predicted protein  51.47 
 
 
184 aa  149  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  139  9e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  47.48 
 
 
141 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  46.58 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05951  hypothetical protein  43.17 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.517381 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  44.9 
 
 
148 aa  128  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  44.22 
 
 
141 aa  126  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39455  predicted protein  40.12 
 
 
244 aa  126  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  46.58 
 
 
142 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  42.76 
 
 
141 aa  122  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  42.76 
 
 
160 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  41.1 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  41.38 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  45.04 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  39.31 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  36.11 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  40.58 
 
 
130 aa  105  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  39.42 
 
 
134 aa  100  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  35.04 
 
 
131 aa  99  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  34.48 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  37.68 
 
 
133 aa  97.8  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  35.97 
 
 
133 aa  97.1  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  35.62 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  35.17 
 
 
137 aa  95.9  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  35.04 
 
 
132 aa  94.4  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  35.71 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  38.35 
 
 
139 aa  93.6  8e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2631  hypothetical protein  32.88 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  39.01 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2106  hypothetical protein  33.56 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  38.3 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  34.56 
 
 
130 aa  91.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  38.35 
 
 
128 aa  91.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  34.03 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  35.82 
 
 
126 aa  90.5  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  35.71 
 
 
133 aa  90.1  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  32.12 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  34.53 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  34.25 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  32.64 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  31.25 
 
 
136 aa  90.1  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  32.85 
 
 
133 aa  89  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  32.85 
 
 
138 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  33.56 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2109  protein of unknown function UPF0047  33.56 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0609464 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  37.6 
 
 
138 aa  88.2  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  32.85 
 
 
131 aa  88.6  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  34.25 
 
 
139 aa  88.2  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1152  hypothetical protein  35.38 
 
 
139 aa  88.2  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  35 
 
 
138 aa  87.8  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1344  hypothetical protein  32.19 
 
 
138 aa  88.2  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2183  hypothetical protein  32.19 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 
584 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  33.81 
 
 
132 aa  87  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  37.68 
 
 
138 aa  87  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3230  hypothetical protein  35.25 
 
 
139 aa  87  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  36.22 
 
 
133 aa  87  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2329  hypothetical protein  33.56 
 
 
157 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561757  normal  0.383888 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0225  hypothetical protein  32.19 
 
 
139 aa  85.9  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0225  hypothetical protein  33.56 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  36.15 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0515  protein of unknown function UPF0047  35.16 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0221734  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  31.94 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1685  hypothetical protein  33.56 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  34.93 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2359  protein of unknown function UPF0047  31.51 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  33.57 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3072  hypothetical protein  32.88 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  34.25 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1739  protein of unknown function UPF0047  30.82 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  33.57 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  32.12 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  33.09 
 
 
143 aa  84.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  32.85 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2363  hypothetical protein  30.14 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100491  normal  0.704799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3144  hypothetical protein  32.88 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  32.85 
 
 
134 aa  84  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2666  protein of unknown function UPF0047  34.62 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  34.06 
 
 
130 aa  83.6  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  34.81 
 
 
135 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  34.81 
 
 
135 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3634  protein of unknown function UPF0047  29.45 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  30.66 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1191  hypothetical protein  31.51 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1065  hypothetical protein  32.19 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00346486  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1410  hypothetical protein  33.56 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  30.66 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0976  protein of unknown function UPF0047  30.82 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.394936  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0111  hypothetical protein  33.09 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000308533 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  31.62 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  32.19 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3409  hypothetical protein  30.82 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000525529  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  34.92 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0254  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 
140 aa  82  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  30.43 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  27.78 
 
 
137 aa  82  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>