289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0111 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0111  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  313  6e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000308533 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  74.82 
 
 
138 aa  219  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1152  hypothetical protein  72.66 
 
 
139 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  71.94 
 
 
139 aa  217  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3230  hypothetical protein  72.66 
 
 
139 aa  217  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  71.22 
 
 
139 aa  215  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  69.78 
 
 
138 aa  215  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1191  hypothetical protein  70.5 
 
 
139 aa  214  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2109  protein of unknown function UPF0047  71.22 
 
 
138 aa  213  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0609464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2183  hypothetical protein  71.22 
 
 
139 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1956  hypothetical protein  70.5 
 
 
139 aa  211  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0266366  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0225  hypothetical protein  69.06 
 
 
139 aa  210  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0225  hypothetical protein  68.35 
 
 
139 aa  210  7e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2363  hypothetical protein  69.06 
 
 
139 aa  209  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100491  normal  0.704799 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2666  protein of unknown function UPF0047  69.78 
 
 
138 aa  209  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  70.5 
 
 
138 aa  209  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3634  protein of unknown function UPF0047  69.78 
 
 
139 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3409  hypothetical protein  70.5 
 
 
139 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000525529  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1520  protein of unknown function UPF0047  67.63 
 
 
139 aa  207  6e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0913014  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0254  protein of unknown function UPF0047  72.14 
 
 
140 aa  206  7e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  69.78 
 
 
139 aa  206  7e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3072  hypothetical protein  69.06 
 
 
138 aa  206  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2329  hypothetical protein  69.78 
 
 
157 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561757  normal  0.383888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3144  hypothetical protein  69.78 
 
 
139 aa  204  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  69.06 
 
 
138 aa  204  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  69.06 
 
 
139 aa  204  5e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0920  protein of unknown function UPF0047  69.06 
 
 
139 aa  203  7e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1065  hypothetical protein  69.06 
 
 
138 aa  203  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00346486  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0955  protein of unknown function UPF0047  66.19 
 
 
139 aa  201  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0812583  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  66.19 
 
 
139 aa  199  8e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1685  hypothetical protein  66.91 
 
 
139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0833  hypothetical protein  66.91 
 
 
139 aa  197  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236299  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1410  hypothetical protein  66.19 
 
 
139 aa  197  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  68.35 
 
 
138 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2631  hypothetical protein  67.63 
 
 
138 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  68.35 
 
 
138 aa  194  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0515  protein of unknown function UPF0047  66.91 
 
 
138 aa  193  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0221734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  66.91 
 
 
584 aa  191  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0976  protein of unknown function UPF0047  64.75 
 
 
138 aa  191  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.394936  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  67.63 
 
 
138 aa  190  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3284  protein of unknown function UPF0047  64.03 
 
 
138 aa  189  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1739  protein of unknown function UPF0047  64.03 
 
 
138 aa  189  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1445  hypothetical protein  63.31 
 
 
138 aa  188  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0875053  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2359  protein of unknown function UPF0047  64.03 
 
 
138 aa  185  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1344  hypothetical protein  64.75 
 
 
138 aa  184  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2106  hypothetical protein  61.59 
 
 
138 aa  179  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  57.55 
 
 
136 aa  167  5e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  56.83 
 
 
136 aa  167  5e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  50.36 
 
 
137 aa  161  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  55.07 
 
 
137 aa  161  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  52.52 
 
 
137 aa  159  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  52.17 
 
 
137 aa  157  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  50.34 
 
 
145 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22360  hypothetical protein  76.04 
 
 
95 aa  154  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  51.08 
 
 
137 aa  151  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  37.86 
 
 
137 aa  94  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  38.17 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  37.78 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  37.6 
 
 
134 aa  89  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  37.4 
 
 
132 aa  89.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  39.52 
 
 
143 aa  89  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  35.88 
 
 
132 aa  87.4  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  37.8 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  36.36 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  35.94 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  35.25 
 
 
130 aa  84.7  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  37.04 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  36.59 
 
 
132 aa  83.6  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  35.88 
 
 
132 aa  83.6  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  37.4 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  31.11 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  33.09 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  31.06 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  34.96 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  36.59 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  32.06 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  32.06 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  32.86 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  35.77 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  32.09 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  35.94 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  33.07 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  31.34 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  34.62 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  29.93 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  33.61 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  31.82 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  35.29 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  35 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  35.29 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  32.82 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  35.48 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  31.71 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  30.83 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  32.35 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  31.94 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  29.37 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>