291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3485 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  290  5e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  98.56 
 
 		 139 aa  286  6e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2363  hypothetical protein  75.54 
 
 		 139 aa  233  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100491  normal  0.704799 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2183  hypothetical protein  75.54 
 
 		 139 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3230  hypothetical protein  74.82 
 
 		 139 aa  230  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2666  protein of unknown function UPF0047  76.26 
 
 		 138 aa  229  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1191  hypothetical protein  75.54 
 
 		 139 aa  228  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1152  hypothetical protein  74.1 
 
 		 139 aa  227  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3634  protein of unknown function UPF0047  75.54 
 
 		 139 aa  227  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2329  hypothetical protein  73.38 
 
 		 157 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561757  normal  0.383888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3409  hypothetical protein  75.54 
 
 		 139 aa  225  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000525529  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3144  hypothetical protein  74.82 
 
 		 139 aa  225  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  75.54 
 
 		 139 aa  224  4e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  74.82 
 
 		 139 aa  221  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0225  hypothetical protein  69.06 
 
 		 139 aa  221  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0225  hypothetical protein  68.35 
 
 		 139 aa  220  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2109  protein of unknown function UPF0047  71.22 
 
 		 138 aa  218  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0609464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3072  hypothetical protein  70.5 
 
 		 138 aa  218  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1685  hypothetical protein  71.22 
 
 		 139 aa  217  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  74.1 
 
 		 138 aa  217  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0111  hypothetical protein  71.22 
 
 		 150 aa  215  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000308533 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  73.38 
 
 		 138 aa  215  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1065  hypothetical protein  71.94 
 
 		 138 aa  213  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00346486  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  70.5 
 
 		 138 aa  214  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1956  hypothetical protein  69.78 
 
 		 139 aa  213  7e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0266366  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  69.78 
 
 		 138 aa  211  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  69.06 
 
 		 138 aa  210  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  71.94 
 
 		 138 aa  210  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1520  protein of unknown function UPF0047  68.35 
 
 		 139 aa  209  9e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0913014  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2359  protein of unknown function UPF0047  69.06 
 
 		 138 aa  208  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0920  protein of unknown function UPF0047  68.35 
 
 		 139 aa  208  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0833  hypothetical protein  69.06 
 
 		 139 aa  207  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  69.78 
 
 		 138 aa  207  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3284  protein of unknown function UPF0047  70.5 
 
 		 138 aa  206  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  69.78 
 
 		 584 aa  206  9e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0976  protein of unknown function UPF0047  70.5 
 
 		 138 aa  206  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.394936  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1410  hypothetical protein  66.19 
 
 		 139 aa  204  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  66.19 
 
 		 139 aa  204  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0955  protein of unknown function UPF0047  66.91 
 
 		 139 aa  204  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0812583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2631  hypothetical protein  69.78 
 
 		 138 aa  202  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2106  hypothetical protein  70.29 
 
 		 138 aa  202  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1445  hypothetical protein  66.91 
 
 		 138 aa  199  7e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0875053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0515  protein of unknown function UPF0047  66.19 
 
 		 138 aa  199  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0221734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1344  hypothetical protein  68.35 
 
 		 138 aa  199  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0254  protein of unknown function UPF0047  66.43 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1739  protein of unknown function UPF0047  64.03 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  61.15 
 
 		 136 aa  184  4e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  61.15 
 
 		 136 aa  180  7e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  57.24 
 
 		 145 aa  174  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  57.55 
 
 		 137 aa  173  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  58.7 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  60.14 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  55.4 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  53.96 
 
 		 137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22360  hypothetical protein  75 
 
 		 95 aa  152  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  37.69 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  36.43 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  39.37 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  40.29 
 
 		 136 aa  94  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  36.84 
 
 		 132 aa  94  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  39.06 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  38.71 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  40.16 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  36.09 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  36.09 
 
 		 132 aa  92.8  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  36.64 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  41.09 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  37.04 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  34.29 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  39.23 
 
 		 132 aa  90.9  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  34.59 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  35.04 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  37.12 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  34.31 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  37.4 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  36.57 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  34.09 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  38.35 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  35.97 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  34.65 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  37.78 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  37.3 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  33.87 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  36.72 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  34.51 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  36.09 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  36.57 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  30.66 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  35.94 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  34.09 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  33.56 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  34.51 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  36.3 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  36.67 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  34.07 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  34.27 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  34.85 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  34.11 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05951  hypothetical protein  34.09 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.517381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>