297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0114 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 		 139 aa  291  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0920  protein of unknown function UPF0047  91.37 
 
 		 139 aa  274  4e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0833  hypothetical protein  87.77 
 
 		 139 aa  261  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236299  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1410  hypothetical protein  87.77 
 
 		 139 aa  259  8.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0955  protein of unknown function UPF0047  84.89 
 
 		 139 aa  251  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0812583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1520  protein of unknown function UPF0047  84.17 
 
 		 139 aa  249  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0913014  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3634  protein of unknown function UPF0047  76.98 
 
 		 139 aa  234  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3072  hypothetical protein  77.7 
 
 		 138 aa  227  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2109  protein of unknown function UPF0047  76.98 
 
 		 138 aa  227  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0609464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  76.98 
 
 		 138 aa  226  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0225  hypothetical protein  75.54 
 
 		 139 aa  226  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1191  hypothetical protein  76.26 
 
 		 139 aa  226  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2183  hypothetical protein  76.26 
 
 		 139 aa  225  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0225  hypothetical protein  74.82 
 
 		 139 aa  225  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2329  hypothetical protein  74.1 
 
 		 157 aa  224  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561757  normal  0.383888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1152  hypothetical protein  75.54 
 
 		 139 aa  223  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3144  hypothetical protein  73.38 
 
 		 139 aa  223  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1956  hypothetical protein  74.82 
 
 		 139 aa  223  9e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0266366  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2363  hypothetical protein  74.82 
 
 		 139 aa  222  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100491  normal  0.704799 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1685  hypothetical protein  74.1 
 
 		 139 aa  221  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3409  hypothetical protein  74.1 
 
 		 139 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000525529  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3230  hypothetical protein  74.82 
 
 		 139 aa  221  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  75.54 
 
 		 138 aa  217  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  70.5 
 
 		 138 aa  213  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1065  hypothetical protein  73.38 
 
 		 138 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00346486  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2666  protein of unknown function UPF0047  71.22 
 
 		 138 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0976  protein of unknown function UPF0047  74.1 
 
 		 138 aa  209  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.394936  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0254  protein of unknown function UPF0047  71.43 
 
 		 140 aa  209  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  69.78 
 
 		 138 aa  209  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  71.22 
 
 		 138 aa  208  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3284  protein of unknown function UPF0047  71.94 
 
 		 138 aa  207  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  66.91 
 
 		 139 aa  207  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  66.19 
 
 		 139 aa  204  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2359  protein of unknown function UPF0047  70.5 
 
 		 138 aa  204  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  67.63 
 
 		 139 aa  203  7e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  69.06 
 
 		 138 aa  202  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  66.91 
 
 		 138 aa  202  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0515  protein of unknown function UPF0047  68.35 
 
 		 138 aa  201  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0221734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  69.06 
 
 		 584 aa  201  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  66.91 
 
 		 139 aa  200  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0111  hypothetical protein  66.19 
 
 		 150 aa  199  7e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000308533 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1344  hypothetical protein  69.06 
 
 		 138 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2106  hypothetical protein  68.84 
 
 		 138 aa  193  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1739  protein of unknown function UPF0047  68.35 
 
 		 138 aa  192  9e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2631  hypothetical protein  68.35 
 
 		 138 aa  191  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1445  hypothetical protein  63.31 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0875053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  53.79 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  55.4 
 
 		 136 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22360  hypothetical protein  79.17 
 
 		 95 aa  161  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  53.62 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  50.36 
 
 		 136 aa  153  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  48.92 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  50.36 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  51.45 
 
 		 137 aa  149  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  51.08 
 
 		 137 aa  146  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  39.29 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  36.09 
 
 		 132 aa  97.1  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  35.34 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  37.98 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  36.03 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  36.43 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  37.4 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  36.84 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  35.71 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  36.09 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  35.56 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  36.09 
 
 		 138 aa  90.5  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  34.85 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  39.53 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  39.68 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  37.88 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  33.58 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  34.4 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  31.5 
 
 		 133 aa  87.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  34.68 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  35.88 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  32.58 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  34.53 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1088  protein of unknown function UPF0047  33.81 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.977912 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  33.09 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  38.28 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  32.84 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  33.83 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  34.62 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  33.83 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  36.07 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  33.83 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  33.08 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  27.41 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  32.19 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  35.38 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  32.09 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  34.03 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  33.07 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  34.4 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  33.07 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  32.65 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  35.54 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  31.82 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  33.08 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>