More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0672 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  290  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  73.53 
 
 
141 aa  216  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  65.25 
 
 
141 aa  204  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  70.63 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  63.57 
 
 
141 aa  197  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  64.71 
 
 
141 aa  196  7.999999999999999e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  62.41 
 
 
148 aa  194  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  60.71 
 
 
140 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  61.43 
 
 
142 aa  180  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  61.03 
 
 
160 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  60.29 
 
 
142 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  47.48 
 
 
146 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  46.21 
 
 
145 aa  134  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  45.83 
 
 
145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  46.21 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  45.86 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  45.6 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40920  predicted protein  41.14 
 
 
184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  41.35 
 
 
137 aa  102  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  41.86 
 
 
137 aa  102  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39455  predicted protein  35.16 
 
 
244 aa  100  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  46.21 
 
 
126 aa  99.4  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  43.86 
 
 
131 aa  98.6  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  40.94 
 
 
133 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  41.04 
 
 
133 aa  97.8  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  36.43 
 
 
137 aa  97.1  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  34.29 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  39.53 
 
 
132 aa  94  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  36.57 
 
 
137 aa  93.6  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  39.68 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  39.85 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  37.01 
 
 
132 aa  92.8  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  36.09 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  41.6 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  35.61 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  37.8 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  35.34 
 
 
132 aa  90.9  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05951  hypothetical protein  38.03 
 
 
154 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.517381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  36.23 
 
 
152 aa  90.9  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  38.35 
 
 
139 aa  90.1  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  34.56 
 
 
143 aa  90.5  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  40.98 
 
 
136 aa  90.1  9e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  38.24 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  39.86 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  34.15 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  34.11 
 
 
136 aa  88.6  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  37.98 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  36.36 
 
 
131 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  33.83 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2666  protein of unknown function UPF0047  38.89 
 
 
138 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3409  hypothetical protein  36.96 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000525529  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  40.34 
 
 
136 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  36.76 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  37.5 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  32.59 
 
 
137 aa  87  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  35.43 
 
 
132 aa  87  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  36.09 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  39.26 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3144  hypothetical protein  37.68 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  34.85 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  35.34 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  35.92 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2106  hypothetical protein  36.62 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  34.59 
 
 
131 aa  85.9  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  35.61 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2109  protein of unknown function UPF0047  37.3 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0609464 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1065  hypothetical protein  38.1 
 
 
138 aa  84.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00346486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.21 
 
 
584 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  35.2 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  34.06 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  36.23 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  36.51 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2329  hypothetical protein  35.51 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561757  normal  0.383888 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  37.3 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1191  hypothetical protein  37.19 
 
 
139 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  31.88 
 
 
138 aa  84  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  35.38 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  36.3 
 
 
138 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  37.3 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2363  hypothetical protein  38.58 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100491  normal  0.704799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  32.54 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  34.09 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3230  hypothetical protein  39.68 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  36.07 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3634  protein of unknown function UPF0047  34.06 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  34.4 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  34.96 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  34.92 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1739  protein of unknown function UPF0047  37.3 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  33.86 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1344  hypothetical protein  35.21 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2183  hypothetical protein  35.66 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  32.58 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  34.56 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  34.92 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  30 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>