More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0242 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  283  5e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  85.4 
 
 
138 aa  246  8e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  87.68 
 
 
138 aa  239  7e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  57.03 
 
 
130 aa  163  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  56.15 
 
 
132 aa  163  8e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  51.54 
 
 
132 aa  157  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  51.16 
 
 
130 aa  157  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  60.63 
 
 
129 aa  156  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  53.08 
 
 
132 aa  155  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  53.97 
 
 
132 aa  155  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  53.85 
 
 
132 aa  154  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  54.89 
 
 
143 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  51.54 
 
 
131 aa  151  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  52.71 
 
 
133 aa  150  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  52.31 
 
 
133 aa  149  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  50.78 
 
 
143 aa  148  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  47.33 
 
 
132 aa  147  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  51.91 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  51.15 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  46.51 
 
 
133 aa  145  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  53.97 
 
 
134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  47.29 
 
 
132 aa  144  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  50.39 
 
 
130 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  48.8 
 
 
131 aa  140  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  50.39 
 
 
136 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  44.96 
 
 
152 aa  140  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  48.46 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  44.53 
 
 
133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  45.45 
 
 
134 aa  137  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  47.29 
 
 
133 aa  137  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  43.85 
 
 
133 aa  136  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  52.59 
 
 
131 aa  136  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  47.24 
 
 
133 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  45.24 
 
 
132 aa  135  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  49.22 
 
 
133 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  44.62 
 
 
132 aa  135  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  46.03 
 
 
132 aa  135  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  46.51 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  45.04 
 
 
132 aa  133  8e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  44.27 
 
 
132 aa  133  8e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  49.61 
 
 
136 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  44.27 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  45.04 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  48.82 
 
 
139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  45.67 
 
 
132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  50.81 
 
 
132 aa  130  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  44.62 
 
 
133 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  43.51 
 
 
131 aa  130  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  44.44 
 
 
131 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  41.67 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  46.09 
 
 
131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  47.24 
 
 
139 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  45.11 
 
 
138 aa  124  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  42.75 
 
 
135 aa  123  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  42.75 
 
 
135 aa  123  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  43.41 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  41.27 
 
 
130 aa  111  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  40.65 
 
 
128 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  38.17 
 
 
143 aa  103  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  40.91 
 
 
137 aa  100  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  32.82 
 
 
134 aa  97.4  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  35.61 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1691  hypothetical protein  41.48 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00156174  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  41.67 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3072  hypothetical protein  34.09 
 
 
138 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  42.86 
 
 
137 aa  92  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1688  hypothetical protein  35.77 
 
 
195 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49270  predicted protein  44.95 
 
 
154 aa  90.9  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  41.51 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  41.51 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  36.09 
 
 
139 aa  90.5  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05191  hypothetical protein  35.62 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0327196  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2109  protein of unknown function UPF0047  36.36 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0609464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  35.04 
 
 
139 aa  90.1  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  34.11 
 
 
137 aa  90.1  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05481  hypothetical protein  37.04 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.339637  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0493  hypothetical protein  37.78 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0896666  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  42.86 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  36.64 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  34.31 
 
 
139 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  51.16 
 
 
140 aa  89  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  40.18 
 
 
148 aa  88.6  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  42.86 
 
 
160 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  42.86 
 
 
160 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  37.6 
 
 
146 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  45.1 
 
 
138 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  40.91 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0920  protein of unknown function UPF0047  33.83 
 
 
139 aa  87.4  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  32.06 
 
 
137 aa  87.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03880  conserved hypothetical protein  49.43 
 
 
140 aa  87  8e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4360  hypothetical protein  39.47 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  35.04 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  35.29 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  33.85 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  41.18 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  45.54 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  34.96 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2666  protein of unknown function UPF0047  34.92 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1152  protein of unknown function UPF0047  37.7 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  hitchhiker  0.00000047058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>