More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3690 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  320  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  73.12 
 
 
160 aa  238  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  72.5 
 
 
160 aa  235  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  71.88 
 
 
160 aa  234  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1542  protein of unknown function UPF0047  61.96 
 
 
166 aa  203  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0627  hypothetical protein  59.51 
 
 
166 aa  194  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  decreased coverage  0.00428994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  64.71 
 
 
157 aa  189  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  56.64 
 
 
155 aa  168  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  60.32 
 
 
157 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1124  hypothetical protein  58.27 
 
 
140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2118  protein of unknown function UPF0047  54.74 
 
 
139 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2219  hypothetical protein  57.14 
 
 
140 aa  154  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.457573 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0081  protein of unknown function UPF0047  51.82 
 
 
139 aa  152  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0686334  normal  0.0165253 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  52.21 
 
 
144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2680  protein of unknown function UPF0047  56.39 
 
 
140 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686166  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  59.52 
 
 
157 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  51.09 
 
 
139 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  51.11 
 
 
138 aa  147  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  52.63 
 
 
137 aa  147  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  56.59 
 
 
139 aa  147  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2940  protein of unknown function UPF0047  56.49 
 
 
140 aa  147  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250526  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1467  hypothetical protein  52.55 
 
 
144 aa  147  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5144  hypothetical protein  56.59 
 
 
139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356001  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  51.85 
 
 
138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  51.85 
 
 
137 aa  145  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  51.85 
 
 
138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3983  hypothetical protein  52.55 
 
 
139 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000552293  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0131  hypothetical protein  54.96 
 
 
139 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1587  hypothetical protein  54.96 
 
 
139 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.185989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0099  hypothetical protein  54.96 
 
 
139 aa  144  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426584  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  56.8 
 
 
139 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0104  hypothetical protein  54.96 
 
 
139 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1335  hypothetical protein  51.08 
 
 
140 aa  143  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970106  decreased coverage  0.00476745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  55.94 
 
 
157 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4069  hypothetical protein  53.38 
 
 
141 aa  143  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491688  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0078  hypothetical protein  49.65 
 
 
149 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2128  hypothetical protein  54.41 
 
 
140 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.594367  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  58.87 
 
 
157 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2889  hypothetical protein  54.26 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  50.36 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  52.38 
 
 
140 aa  137  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  53.49 
 
 
139 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  53.49 
 
 
139 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3367  hypothetical protein  53.49 
 
 
139 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00750068  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3095  hypothetical protein  52.46 
 
 
126 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0121064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  51.85 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2258  hypothetical protein  50 
 
 
139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.479021 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2137  hypothetical protein  49.23 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.435583  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0643  protein of unknown function UPF0047  47.79 
 
 
142 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1688  hypothetical protein  45.59 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1102  hypothetical protein  50.38 
 
 
139 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6559  protein of unknown function UPF0047  48.18 
 
 
143 aa  126  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552252  normal  0.186603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  48.48 
 
 
137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  45.67 
 
 
139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0674  hypothetical protein  46.56 
 
 
205 aa  124  7e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.798458  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04921  hypothetical protein  38.46 
 
 
212 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0925424  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0632  hypothetical protein  45.8 
 
 
139 aa  120  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1762  hypothetical protein  47.45 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292066  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1264  hypothetical cytosolic protein  47.41 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1322  hypothetical protein  47.41 
 
 
139 aa  118  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1293  hypothetical protein  48.46 
 
 
140 aa  117  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1825  hypothetical protein  37.96 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05491  hypothetical protein  37.96 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.985204  normal  0.552245 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07151  hypothetical protein  41.5 
 
 
156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05561  hypothetical protein  38.19 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1152  protein of unknown function UPF0047  47.33 
 
 
139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  hitchhiker  0.00000047058 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1691  hypothetical protein  43.94 
 
 
138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00156174  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0742  conserved hypothetical protein TIGR00149  41.61 
 
 
143 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49270  predicted protein  42.96 
 
 
154 aa  112  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0889  protein of unknown function UPF0047  41.61 
 
 
143 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32835  conserved hypothetical protein  49.02 
 
 
147 aa  111  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.805601  normal  0.755477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  46.3 
 
 
139 aa  110  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  50.94 
 
 
145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  45.8 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  52.43 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0493  hypothetical protein  37.06 
 
 
151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  43.61 
 
 
140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  45.16 
 
 
140 aa  107  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0485  hypothetical protein  46.22 
 
 
141 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361267  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05481  hypothetical protein  37.06 
 
 
151 aa  107  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.339637  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05191  hypothetical protein  37.06 
 
 
151 aa  107  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0327196  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  51.46 
 
 
148 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0559  hypothetical protein  48.33 
 
 
139 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0261  hypothetical protein  49.07 
 
 
141 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2650  hypothetical protein  43.61 
 
 
139 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  48.54 
 
 
139 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69780  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.570881 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2351  hypothetical protein  45.97 
 
 
141 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0140381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6028  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  47.5 
 
 
141 aa  103  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4360  hypothetical protein  39.85 
 
 
139 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2162  hypothetical protein  49.5 
 
 
134 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2136  hypothetical protein  49.5 
 
 
134 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  45.9 
 
 
143 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0065  hypothetical protein  38.52 
 
 
139 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  46.3 
 
 
140 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1039  protein of unknown function UPF0047  46.67 
 
 
141 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  47.57 
 
 
139 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  45.28 
 
 
139 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>