289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4360 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4360  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  291  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  72.66 
 
 		 159 aa  226  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  71.94 
 
 		 148 aa  226  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  64.03 
 
 		 139 aa  206  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2650  hypothetical protein  64.75 
 
 		 139 aa  205  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  64.75 
 
 		 139 aa  202  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  63.31 
 
 		 139 aa  201  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  64.03 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  61.87 
 
 		 145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0559  hypothetical protein  60.43 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0527  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  60.43 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  59.71 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  57.55 
 
 		 139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3740  hypothetical protein  59.71 
 
 		 141 aa  186  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.597829  hitchhiker  0.000337865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1893  hypothetical protein  57.55 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.323991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1039  protein of unknown function UPF0047  59.71 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1665  hypothetical protein  59.71 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0693  protein of unknown function UPF0047  64.75 
 
 		 139 aa  180  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5504  hypothetical protein  57.55 
 
 		 141 aa  180  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  58.82 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03928  hypothetical protein  58.27 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3936  protein of unknown function UPF0047  58.27 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4518  hypothetical protein  58.27 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5559  conserved hypothetical protein TIGR00149  58.27 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.484103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3971  hypothetical protein  58.27 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.147621 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03888  hypothetical protein  58.27 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.143638  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4298  hypothetical protein  58.27 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4608  hypothetical protein  58.27 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4570  hypothetical protein  57.55 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1889  protein of unknown function UPF0047  63.31 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0219  hypothetical protein  54.68 
 
 		 141 aa  173  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47770  hypothetical protein  55.4 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0188  hypothetical protein  54.68 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2351  hypothetical protein  57.25 
 
 		 141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0140381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6028  hypothetical protein  56.12 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69780  hypothetical protein  56.83 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.570881 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4444  hypothetical protein  61.87 
 
 		 138 aa  168  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.388057 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0261  hypothetical protein  58.27 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  55.15 
 
 		 140 aa  167  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4594  hypothetical protein  59.71 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4593  hypothetical protein  59.71 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4645  hypothetical protein  59.71 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.462887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4499  hypothetical protein  59.71 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  55.4 
 
 		 141 aa  163  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4507  hypothetical protein  59.71 
 
 		 138 aa  163  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2246  protein of unknown function UPF0047  52.55 
 
 		 140 aa  163  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  51.82 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  56.15 
 
 		 140 aa  153  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49270  predicted protein  48.65 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32835  conserved hypothetical protein  52.9 
 
 		 147 aa  150  5.9999999999999996e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.805601  normal  0.755477 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0485  hypothetical protein  50.74 
 
 		 141 aa  147  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2109  hypothetical protein  51.8 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08050  UPF0047 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G02090)  45 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.823848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  45.11 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  44.93 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  47.06 
 
 		 138 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  47.06 
 
 		 138 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1335  hypothetical protein  43.61 
 
 		 140 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970106  decreased coverage  0.00476745 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3983  hypothetical protein  44.36 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000552293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1762  hypothetical protein  42.86 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292066  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2136  hypothetical protein  48.84 
 
 		 134 aa  124  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1102  hypothetical protein  42.65 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6559  protein of unknown function UPF0047  43.18 
 
 		 143 aa  124  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552252  normal  0.186603 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2162  hypothetical protein  48.84 
 
 		 134 aa  123  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2137  hypothetical protein  44.44 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.435583  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0131  hypothetical protein  43.61 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0643  protein of unknown function UPF0047  41.04 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1587  hypothetical protein  43.61 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.185989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0099  hypothetical protein  43.61 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0104  hypothetical protein  43.61 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1691  hypothetical protein  40.29 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00156174  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0065  hypothetical protein  43.8 
 
 		 139 aa  120  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  42.65 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1293  hypothetical protein  40.15 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0632  hypothetical protein  37.96 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  41.61 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  42.11 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2118  protein of unknown function UPF0047  39.55 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5144  hypothetical protein  46.79 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  40.6 
 
 		 139 aa  114  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0078  hypothetical protein  38.78 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3367  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00750068  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03880  conserved hypothetical protein  47.24 
 
 		 140 aa  113  8.999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2258  hypothetical protein  48.65 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.479021 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1152  protein of unknown function UPF0047  39.42 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  hitchhiker  0.00000047058 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1322  hypothetical protein  41.73 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1264  hypothetical cytosolic protein  41.73 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  43.75 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4069  hypothetical protein  40.3 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491688  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2889  hypothetical protein  40.74 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0674  hypothetical protein  44.78 
 
 		 205 aa  110  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.798458  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  42.97 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1688  hypothetical protein  43.28 
 
 		 195 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2219  hypothetical protein  42.54 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.457573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  44.35 
 
 		 157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  41.61 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  43.7 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>