More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1703 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 		 140 aa  290  5e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  63.85 
 
 		 139 aa  174  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  65.38 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  64.62 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  62.5 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  60.77 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  61.54 
 
 		 139 aa  166  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  59.56 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1889  protein of unknown function UPF0047  67.16 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  61.54 
 
 		 141 aa  163  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  60.45 
 
 		 141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  56.93 
 
 		 139 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0559  hypothetical protein  63.85 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  61.54 
 
 		 139 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0527  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  59.23 
 
 		 139 aa  157  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5504  hypothetical protein  57.46 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  57.66 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2650  hypothetical protein  60.16 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3740  hypothetical protein  60.77 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.597829  hitchhiker  0.000337865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1039  protein of unknown function UPF0047  58.91 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0693  protein of unknown function UPF0047  64.12 
 
 		 139 aa  153  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4360  hypothetical protein  56.15 
 
 		 139 aa  153  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47770  hypothetical protein  61.72 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0188  hypothetical protein  61.83 
 
 		 141 aa  151  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49270  predicted protein  59.52 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2351  hypothetical protein  57.69 
 
 		 141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0140381  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03928  hypothetical protein  55.81 
 
 		 138 aa  150  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3936  protein of unknown function UPF0047  55.81 
 
 		 138 aa  150  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03888  hypothetical protein  55.81 
 
 		 138 aa  150  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.143638  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3971  hypothetical protein  55.81 
 
 		 138 aa  150  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.147621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2246  protein of unknown function UPF0047  58.21 
 
 		 140 aa  150  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4518  hypothetical protein  55.81 
 
 		 138 aa  150  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4298  hypothetical protein  55.81 
 
 		 138 aa  150  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5559  conserved hypothetical protein TIGR00149  55.81 
 
 		 138 aa  150  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.484103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1665  hypothetical protein  57.69 
 
 		 139 aa  150  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0485  hypothetical protein  54.35 
 
 		 141 aa  149  8.999999999999999e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0219  hypothetical protein  61.07 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4608  hypothetical protein  55.04 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4570  hypothetical protein  55.04 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  53.08 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1893  hypothetical protein  53.85 
 
 		 139 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.323991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6028  hypothetical protein  55.64 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69780  hypothetical protein  54.89 
 
 		 141 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.570881 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4444  hypothetical protein  60.63 
 
 		 138 aa  140  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.388057 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4593  hypothetical protein  55.04 
 
 		 138 aa  139  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4499  hypothetical protein  55.04 
 
 		 138 aa  139  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4645  hypothetical protein  55.04 
 
 		 138 aa  139  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.462887 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4594  hypothetical protein  55.04 
 
 		 138 aa  139  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0261  hypothetical protein  58.46 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4507  hypothetical protein  54.26 
 
 		 138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2136  hypothetical protein  49.28 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2162  hypothetical protein  49.28 
 
 		 134 aa  133  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32835  conserved hypothetical protein  47.24 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.805601  normal  0.755477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  49.26 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2109  hypothetical protein  57.69 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  61.22 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1102  hypothetical protein  47.86 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  61.22 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  51.22 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08050  UPF0047 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G02090)  43.85 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.823848  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03880  conserved hypothetical protein  52.34 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  53.57 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0643  protein of unknown function UPF0047  49.21 
 
 		 142 aa  115  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  45.45 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  45.45 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2940  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 		 140 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  53.92 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2680  protein of unknown function UPF0047  47.83 
 
 		 140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  63.53 
 
 		 157 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1762  hypothetical protein  47.33 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2258  hypothetical protein  55.34 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.479021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2219  hypothetical protein  53.77 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.457573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  50.41 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0632  hypothetical protein  46.38 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4069  hypothetical protein  45.74 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491688  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  48.03 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1467  hypothetical protein  48.44 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  49.11 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1691  hypothetical protein  47.5 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00156174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  55.21 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  56.25 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  61.63 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  59.3 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2128  hypothetical protein  50.39 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.594367  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3095  hypothetical protein  54.72 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0121064  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  42.75 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6559  protein of unknown function UPF0047  54.46 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552252  normal  0.186603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2137  hypothetical protein  44.12 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.435583  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1542  protein of unknown function UPF0047  50.86 
 
 		 166 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  44.36 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  46.83 
 
 		 140 aa  106  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1264  hypothetical cytosolic protein  45.38 
 
 		 150 aa  105  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1587  hypothetical protein  47.45 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.185989  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1688  hypothetical protein  50.96 
 
 		 195 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1322  hypothetical protein  45.38 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0099  hypothetical protein  47.45 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0131  hypothetical protein  47.45 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0104  hypothetical protein  47.45 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>