293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1542 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1542  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 		 166 aa  334  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0627  hypothetical protein  83.13 
 
 		 166 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  decreased coverage  0.00428994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  64.42 
 
 		 160 aa  206  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  63.19 
 
 		 160 aa  206  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  62.58 
 
 		 160 aa  203  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  61.96 
 
 		 160 aa  203  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  55.69 
 
 		 157 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2219  hypothetical protein  52.41 
 
 		 140 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.457573 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1124  hypothetical protein  51.97 
 
 		 140 aa  158  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  49.7 
 
 		 155 aa  157  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0081  protein of unknown function UPF0047  51.97 
 
 		 139 aa  157  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0686334  normal  0.0165253 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2118  protein of unknown function UPF0047  51.32 
 
 		 139 aa  156  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2940  protein of unknown function UPF0047  54.48 
 
 		 140 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2680  protein of unknown function UPF0047  53.79 
 
 		 140 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  51.77 
 
 		 157 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  50.66 
 
 		 144 aa  153  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1467  hypothetical protein  52.74 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  48.65 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0078  hypothetical protein  53.02 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2137  hypothetical protein  50.68 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.435583  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  50.98 
 
 		 140 aa  144  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  48.97 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  52.82 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3095  hypothetical protein  51.85 
 
 		 126 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0121064  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  47.26 
 
 		 138 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  47.26 
 
 		 138 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0104  hypothetical protein  48.68 
 
 		 139 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1587  hypothetical protein  48.68 
 
 		 139 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.185989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0099  hypothetical protein  48.68 
 
 		 139 aa  140  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0131  hypothetical protein  48.68 
 
 		 139 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3983  hypothetical protein  48.03 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000552293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2128  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.594367  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  48.68 
 
 		 139 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5144  hypothetical protein  48.03 
 
 		 139 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  47.37 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  50.72 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2258  hypothetical protein  48.23 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.479021 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05491  hypothetical protein  40.79 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.985204  normal  0.552245 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04921  hypothetical protein  42.11 
 
 		 212 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0925424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  46.05 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  48.63 
 
 		 138 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1335  hypothetical protein  46.1 
 
 		 140 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970106  decreased coverage  0.00476745 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  46.05 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  43.84 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3367  hypothetical protein  46.05 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00750068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4069  hypothetical protein  46.98 
 
 		 141 aa  133  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491688  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1825  hypothetical protein  40.13 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1102  hypothetical protein  48.63 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2889  hypothetical protein  45.39 
 
 		 139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  44.37 
 
 		 139 aa  130  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6559  protein of unknown function UPF0047  46.05 
 
 		 143 aa  130  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552252  normal  0.186603 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0643  protein of unknown function UPF0047  45.7 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  46.05 
 
 		 139 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1762  hypothetical protein  46.71 
 
 		 142 aa  127  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1688  hypothetical protein  46.05 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0674  hypothetical protein  44.08 
 
 		 205 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.798458  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  45.58 
 
 		 137 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07151  hypothetical protein  44.74 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0632  hypothetical protein  43.15 
 
 		 139 aa  121  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1293  hypothetical protein  45.89 
 
 		 140 aa  120  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05561  hypothetical protein  37.25 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32835  conserved hypothetical protein  39.86 
 
 		 147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.805601  normal  0.755477 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49270  predicted protein  44.44 
 
 		 154 aa  114  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1691  hypothetical protein  42.67 
 
 		 138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00156174  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0493  hypothetical protein  35.95 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0896666  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0742  conserved hypothetical protein TIGR00149  37.5 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0889  protein of unknown function UPF0047  37.5 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05481  hypothetical protein  37.09 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.339637  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05191  hypothetical protein  36.6 
 
 		 151 aa  111  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0327196  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1152  protein of unknown function UPF0047  45.21 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  hitchhiker  0.00000047058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  39.07 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  41.22 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  50.86 
 
 		 140 aa  107  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1264  hypothetical cytosolic protein  38.92 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2650  hypothetical protein  41.5 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0188  hypothetical protein  43.92 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1322  hypothetical protein  40.54 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0219  hypothetical protein  43.24 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0065  hypothetical protein  39.04 
 
 		 139 aa  104  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  41.5 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0527  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  37.16 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  41.55 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  40.14 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  39.44 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  43.17 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6028  hypothetical protein  42.96 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  36.73 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0559  hypothetical protein  41.5 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  38.1 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47770  hypothetical protein  43.57 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0261  hypothetical protein  44.92 
 
 		 141 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5504  hypothetical protein  40.14 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69780  hypothetical protein  40.82 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.570881 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2351  hypothetical protein  38.78 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0140381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4360  hypothetical protein  34.01 
 
 		 139 aa  98.6  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  39.86 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  42.14 
 
 		 141 aa  98.2  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  39.46 
 
 		 140 aa  98.2  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>