More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0918 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 		 157 aa  316  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  79.49 
 
 		 157 aa  233  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  80.13 
 
 		 157 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  68.87 
 
 		 155 aa  225  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  72.73 
 
 		 157 aa  223  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  67.15 
 
 		 157 aa  187  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  60.84 
 
 		 160 aa  176  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  61.43 
 
 		 160 aa  174  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  61.59 
 
 		 160 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  59.29 
 
 		 160 aa  171  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1542  protein of unknown function UPF0047  54.09 
 
 		 166 aa  167  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0627  hypothetical protein  52.2 
 
 		 166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  decreased coverage  0.00428994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  57.69 
 
 		 138 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  57.69 
 
 		 138 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5144  hypothetical protein  58.14 
 
 		 139 aa  156  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  53.9 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2118  protein of unknown function UPF0047  57.25 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0131  hypothetical protein  57.25 
 
 		 139 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1587  hypothetical protein  57.25 
 
 		 139 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.185989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0099  hypothetical protein  57.25 
 
 		 139 aa  154  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0104  hypothetical protein  57.25 
 
 		 139 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  53.44 
 
 		 139 aa  154  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2940  protein of unknown function UPF0047  55.07 
 
 		 140 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2219  hypothetical protein  55.47 
 
 		 140 aa  153  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.457573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  56.59 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0081  protein of unknown function UPF0047  54.96 
 
 		 139 aa  153  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0686334  normal  0.0165253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  58.14 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2128  hypothetical protein  54.81 
 
 		 140 aa  151  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.594367  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2889  hypothetical protein  55.81 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2680  protein of unknown function UPF0047  54.35 
 
 		 140 aa  150  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  55.04 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  55.04 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3367  hypothetical protein  55.04 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00750068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  52.31 
 
 		 137 aa  148  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  55.56 
 
 		 140 aa  147  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3983  hypothetical protein  53.44 
 
 		 139 aa  147  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000552293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  51.52 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1335  hypothetical protein  51.15 
 
 		 140 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970106  decreased coverage  0.00476745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1467  hypothetical protein  50.72 
 
 		 144 aa  143  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0078  hypothetical protein  50.35 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  48.85 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1124  hypothetical protein  51.11 
 
 		 140 aa  141  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2258  hypothetical protein  49.63 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.479021 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4069  hypothetical protein  51.45 
 
 		 141 aa  140  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491688  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  53.44 
 
 		 138 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  51.91 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  50.38 
 
 		 137 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0643  protein of unknown function UPF0047  52.67 
 
 		 142 aa  137  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3095  hypothetical protein  54.92 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0121064  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2137  hypothetical protein  47.1 
 
 		 142 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.435583  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  47.66 
 
 		 139 aa  133  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0889  protein of unknown function UPF0047  47.06 
 
 		 143 aa  130  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0742  conserved hypothetical protein TIGR00149  47.06 
 
 		 143 aa  130  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1762  hypothetical protein  51.91 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07151  hypothetical protein  46.81 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6559  protein of unknown function UPF0047  52.27 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552252  normal  0.186603 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0632  hypothetical protein  44.85 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04921  hypothetical protein  44.76 
 
 		 212 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0925424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1102  hypothetical protein  45.99 
 
 		 139 aa  127  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1825  hypothetical protein  41.96 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  57.27 
 
 		 140 aa  125  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05491  hypothetical protein  41.96 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.985204  normal  0.552245 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1688  hypothetical protein  48.46 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1691  hypothetical protein  47.06 
 
 		 138 aa  120  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00156174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1152  protein of unknown function UPF0047  45.99 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  hitchhiker  0.00000047058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  51.26 
 
 		 139 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1665  hypothetical protein  51.26 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  53.17 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  51.61 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05561  hypothetical protein  39.58 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1322  hypothetical protein  42.75 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1264  hypothetical cytosolic protein  42.75 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  44.03 
 
 		 140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0674  hypothetical protein  46.15 
 
 		 205 aa  117  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.798458  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2246  protein of unknown function UPF0047  54.17 
 
 		 140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  52.21 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  50.81 
 
 		 139 aa  117  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  43.48 
 
 		 140 aa  117  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0261  hypothetical protein  50.93 
 
 		 141 aa  117  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  48.39 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  51.26 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  55.45 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  46.21 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0493  hypothetical protein  40.56 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0896666  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49270  predicted protein  46.81 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1293  hypothetical protein  46.15 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32835  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.805601  normal  0.755477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47770  hypothetical protein  49.58 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0219  hypothetical protein  49.58 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2162  hypothetical protein  49.48 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2136  hypothetical protein  49.48 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05481  hypothetical protein  40.56 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.339637  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2650  hypothetical protein  46.97 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  45.04 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05191  hypothetical protein  40.56 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0327196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0188  hypothetical protein  51.82 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0485  hypothetical protein  49.15 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1039  protein of unknown function UPF0047  46.67 
 
 		 141 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0559  hypothetical protein  51.26 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  45.8 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>