276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2109 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2109  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  280  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0219  hypothetical protein  62.41 
 
 
141 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69780  hypothetical protein  63.83 
 
 
141 aa  178  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.570881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6028  hypothetical protein  64.54 
 
 
141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47770  hypothetical protein  65.22 
 
 
141 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5504  hypothetical protein  61.7 
 
 
141 aa  174  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387087  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0188  hypothetical protein  61.87 
 
 
141 aa  174  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  58.57 
 
 
148 aa  174  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  58.27 
 
 
159 aa  173  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1665  hypothetical protein  58.99 
 
 
139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000223212  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  57.55 
 
 
139 aa  170  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03928  hypothetical protein  58.27 
 
 
138 aa  165  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3936  protein of unknown function UPF0047  58.27 
 
 
138 aa  165  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3971  hypothetical protein  58.27 
 
 
138 aa  165  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.147621 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4518  hypothetical protein  58.27 
 
 
138 aa  165  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03888  hypothetical protein  58.27 
 
 
138 aa  165  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.143638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5559  conserved hypothetical protein TIGR00149  58.27 
 
 
138 aa  165  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.484103  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4298  hypothetical protein  58.27 
 
 
138 aa  165  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1889  protein of unknown function UPF0047  61.43 
 
 
143 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4608  hypothetical protein  57.55 
 
 
138 aa  163  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4570  hypothetical protein  57.55 
 
 
138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  59.29 
 
 
141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  56.83 
 
 
141 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  53.62 
 
 
145 aa  161  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0261  hypothetical protein  59.71 
 
 
141 aa  159  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  52.52 
 
 
139 aa  159  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0559  hypothetical protein  56.83 
 
 
139 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4360  hypothetical protein  51.8 
 
 
139 aa  159  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  49.64 
 
 
139 aa  155  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  51.08 
 
 
139 aa  153  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3740  hypothetical protein  48.94 
 
 
141 aa  150  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.597829  hitchhiker  0.000337865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 
140 aa  149  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2650  hypothetical protein  48.92 
 
 
139 aa  148  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1039  protein of unknown function UPF0047  54.68 
 
 
141 aa  148  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2351  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0140381  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  49.64 
 
 
139 aa  147  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32835  conserved hypothetical protein  51.09 
 
 
147 aa  147  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.805601  normal  0.755477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0527  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  50.36 
 
 
139 aa  146  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  49.62 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0693  protein of unknown function UPF0047  53.96 
 
 
139 aa  143  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1893  hypothetical protein  46.76 
 
 
139 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.323991 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4444  hypothetical protein  59.71 
 
 
138 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.388057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  50.39 
 
 
140 aa  140  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4593  hypothetical protein  53.96 
 
 
138 aa  136  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4594  hypothetical protein  53.96 
 
 
138 aa  136  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916716  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4645  hypothetical protein  53.96 
 
 
138 aa  136  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.462887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4499  hypothetical protein  53.96 
 
 
138 aa  136  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  57.69 
 
 
140 aa  135  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4507  hypothetical protein  53.24 
 
 
138 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08050  UPF0047 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G02090)  45 
 
 
144 aa  133  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.823848  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2246  protein of unknown function UPF0047  46.72 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0485  hypothetical protein  47.06 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361267  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49270  predicted protein  45.58 
 
 
154 aa  118  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0643  protein of unknown function UPF0047  47.37 
 
 
142 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1102  hypothetical protein  45.52 
 
 
139 aa  113  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2136  hypothetical protein  41.48 
 
 
134 aa  111  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2162  hypothetical protein  41.48 
 
 
134 aa  110  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  41.18 
 
 
138 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  41.18 
 
 
138 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1691  hypothetical protein  47.97 
 
 
138 aa  107  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00156174  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  52.88 
 
 
139 aa  107  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1293  hypothetical protein  52.73 
 
 
140 aa  107  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1322  hypothetical protein  41.13 
 
 
139 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  42.86 
 
 
138 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1264  hypothetical cytosolic protein  41.13 
 
 
150 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0632  hypothetical protein  40.15 
 
 
139 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1762  hypothetical protein  43.28 
 
 
142 aa  103  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292066  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  42.98 
 
 
138 aa  103  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6559  protein of unknown function UPF0047  50.93 
 
 
143 aa  103  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552252  normal  0.186603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2258  hypothetical protein  48.62 
 
 
139 aa  103  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.479021 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  47.66 
 
 
139 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2137  hypothetical protein  41.48 
 
 
142 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.435583  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5144  hypothetical protein  46.73 
 
 
139 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356001  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1152  protein of unknown function UPF0047  42.34 
 
 
139 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  hitchhiker  0.00000047058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1335  hypothetical protein  39.85 
 
 
140 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970106  decreased coverage  0.00476745 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  46.73 
 
 
139 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0078  hypothetical protein  38.78 
 
 
149 aa  100  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0065  hypothetical protein  37.96 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  45.97 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07151  hypothetical protein  47.27 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2118  protein of unknown function UPF0047  42.86 
 
 
139 aa  99.4  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  36.03 
 
 
139 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  40.58 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  39.85 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0081  protein of unknown function UPF0047  48.6 
 
 
139 aa  97.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0686334  normal  0.0165253 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1467  hypothetical protein  45.87 
 
 
144 aa  97.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 
140 aa  98.2  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3095  hypothetical protein  45.79 
 
 
126 aa  97.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0121064  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  42.15 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  42.15 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2128  hypothetical protein  47.66 
 
 
140 aa  97.4  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.594367  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3367  hypothetical protein  42.15 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00750068  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  45.6 
 
 
157 aa  96.7  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  41.6 
 
 
137 aa  96.7  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3983  hypothetical protein  39.85 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000552293  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03880  conserved hypothetical protein  38.85 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1124  hypothetical protein  45.19 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2219  hypothetical protein  43.38 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.457573 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2889  hypothetical protein  44.86 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  45 
 
 
160 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>