298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1889 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1889  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 		 143 aa  292  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  77.86 
 
 		 141 aa  218  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  71.94 
 
 		 141 aa  214  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  66.19 
 
 		 139 aa  208  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2650  hypothetical protein  66.19 
 
 		 139 aa  206  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  65.47 
 
 		 139 aa  204  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  66.19 
 
 		 159 aa  205  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  66.91 
 
 		 140 aa  205  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  67.63 
 
 		 139 aa  204  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  64.44 
 
 		 140 aa  202  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  66.19 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0559  hypothetical protein  66.19 
 
 		 139 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  60.43 
 
 		 139 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5504  hypothetical protein  66.19 
 
 		 141 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1039  protein of unknown function UPF0047  66.67 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  62.96 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1665  hypothetical protein  64.75 
 
 		 139 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6028  hypothetical protein  67.63 
 
 		 141 aa  193  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47770  hypothetical protein  67.39 
 
 		 141 aa  192  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0188  hypothetical protein  68.35 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0219  hypothetical protein  66.91 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0693  protein of unknown function UPF0047  72.66 
 
 		 139 aa  192  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0527  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  62.59 
 
 		 139 aa  191  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  59.71 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69780  hypothetical protein  66.91 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.570881 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2351  hypothetical protein  62.59 
 
 		 141 aa  191  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0140381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4360  hypothetical protein  63.31 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0261  hypothetical protein  69.06 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  58.27 
 
 		 139 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1893  hypothetical protein  58.99 
 
 		 139 aa  186  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.323991 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03928  hypothetical protein  61.15 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3936  protein of unknown function UPF0047  61.15 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03888  hypothetical protein  61.15 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.143638  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4518  hypothetical protein  61.15 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3971  hypothetical protein  61.15 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.147621 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4298  hypothetical protein  61.15 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5559  conserved hypothetical protein TIGR00149  61.15 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.484103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3740  hypothetical protein  63.31 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.597829  hitchhiker  0.000337865 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4608  hypothetical protein  60.43 
 
 		 138 aa  180  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4570  hypothetical protein  59.71 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  69.23 
 
 		 140 aa  176  8e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2246  protein of unknown function UPF0047  58.82 
 
 		 140 aa  175  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4645  hypothetical protein  66.19 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.462887 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4594  hypothetical protein  66.19 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4593  hypothetical protein  66.19 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4499  hypothetical protein  66.19 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4507  hypothetical protein  65.47 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32835  conserved hypothetical protein  51.41 
 
 		 147 aa  160  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.805601  normal  0.755477 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2109  hypothetical protein  61.43 
 
 		 141 aa  159  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4444  hypothetical protein  64.03 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.388057 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49270  predicted protein  51.33 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1102  hypothetical protein  52.94 
 
 		 139 aa  147  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0485  hypothetical protein  52.17 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361267  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08050  UPF0047 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G02090)  46.1 
 
 		 144 aa  140  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.823848  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2136  hypothetical protein  52.63 
 
 		 134 aa  138  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1691  hypothetical protein  51.08 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00156174  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2162  hypothetical protein  52.63 
 
 		 134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1293  hypothetical protein  56.8 
 
 		 140 aa  136  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0643  protein of unknown function UPF0047  48.57 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6559  protein of unknown function UPF0047  51.85 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552252  normal  0.186603 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1762  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  45.93 
 
 		 138 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  45.93 
 
 		 138 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1264  hypothetical cytosolic protein  47.52 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1322  hypothetical protein  47.48 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0632  hypothetical protein  47.06 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  55.3 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  52.8 
 
 		 140 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  54.81 
 
 		 139 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  46.38 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1335  hypothetical protein  45.11 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970106  decreased coverage  0.00476745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  44.12 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1587  hypothetical protein  49.62 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.185989  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0104  hypothetical protein  49.62 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0099  hypothetical protein  49.62 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426584  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5144  hypothetical protein  53.21 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0131  hypothetical protein  49.62 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2118  protein of unknown function UPF0047  45.93 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  53.21 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  49.22 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  45.11 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  44.53 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  50.76 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3983  hypothetical protein  46.67 
 
 		 139 aa  120  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000552293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2137  hypothetical protein  46.72 
 
 		 142 aa  120  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.435583  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2258  hypothetical protein  52.38 
 
 		 139 aa  120  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.479021 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0065  hypothetical protein  44.12 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  41.48 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2889  hypothetical protein  46.62 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0889  protein of unknown function UPF0047  47.2 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0742  conserved hypothetical protein TIGR00149  47.2 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2128  hypothetical protein  50.78 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.594367  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  48.48 
 
 		 160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  45 
 
 		 139 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3367  hypothetical protein  45 
 
 		 139 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00750068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  45 
 
 		 139 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  48.53 
 
 		 155 aa  115  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1152  protein of unknown function UPF0047  44.85 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  hitchhiker  0.00000047058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>