More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0431 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  271  3e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  65.38 
 
 
132 aa  185  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  63.85 
 
 
132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  58.73 
 
 
129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  57.58 
 
 
132 aa  170  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  59.54 
 
 
132 aa  169  9e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  56.06 
 
 
132 aa  169  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  54.55 
 
 
132 aa  167  6e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  58.91 
 
 
130 aa  166  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  54.62 
 
 
132 aa  164  5e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  55.04 
 
 
130 aa  161  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  58.02 
 
 
132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  54.26 
 
 
131 aa  160  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  53.08 
 
 
133 aa  158  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  55.38 
 
 
132 aa  154  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  49.62 
 
 
138 aa  153  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  51.94 
 
 
132 aa  153  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  54.2 
 
 
143 aa  153  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  51.13 
 
 
132 aa  150  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  51.52 
 
 
133 aa  148  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  50.38 
 
 
132 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  49.61 
 
 
131 aa  147  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  54.62 
 
 
132 aa  148  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  147  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  47.33 
 
 
138 aa  147  4e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  49.22 
 
 
143 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  50.75 
 
 
136 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  52.27 
 
 
134 aa  146  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  53.08 
 
 
133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  52.42 
 
 
133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  49.63 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  53.08 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  49.25 
 
 
133 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  51.49 
 
 
133 aa  142  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  47.33 
 
 
138 aa  142  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  49.24 
 
 
133 aa  141  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  50 
 
 
132 aa  141  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  46.92 
 
 
132 aa  139  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  51.26 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  45.38 
 
 
130 aa  138  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  49.21 
 
 
133 aa  137  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  49.19 
 
 
152 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  48.36 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  43.08 
 
 
131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  44.88 
 
 
134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  48.46 
 
 
133 aa  131  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  47.29 
 
 
131 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  45.45 
 
 
132 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  48.87 
 
 
136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  48.87 
 
 
139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  41.79 
 
 
138 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  48.09 
 
 
135 aa  125  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  48.09 
 
 
135 aa  125  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  47.37 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  46.56 
 
 
134 aa  122  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  43.75 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  47.97 
 
 
128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  42.19 
 
 
128 aa  107  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  41.54 
 
 
134 aa  107  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  41.22 
 
 
136 aa  103  6e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  39.53 
 
 
143 aa  103  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  42.52 
 
 
130 aa  103  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  39.69 
 
 
132 aa  100  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  39.37 
 
 
136 aa  97.1  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1293  hypothetical protein  44.09 
 
 
140 aa  97.1  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  37.4 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  42.52 
 
 
161 aa  95.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  38.76 
 
 
126 aa  94.7  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2219  hypothetical protein  40.48 
 
 
140 aa  94.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.457573 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  37.82 
 
 
136 aa  94  7e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  33.83 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  36.43 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  37.8 
 
 
137 aa  90.5  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  39.23 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  38.58 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  39.23 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  44.35 
 
 
138 aa  90.1  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  34.11 
 
 
137 aa  90.1  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  40.68 
 
 
139 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  43.56 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  36.72 
 
 
136 aa  89.4  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  38.02 
 
 
160 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1152  protein of unknown function UPF0047  36.97 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  hitchhiker  0.00000047058 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  44.66 
 
 
140 aa  88.2  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  38.35 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3095  hypothetical protein  38.1 
 
 
126 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0121064  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  43.81 
 
 
140 aa  87.8  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  35.11 
 
 
155 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  43.69 
 
 
137 aa  88.2  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1467  hypothetical protein  34.85 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  33.85 
 
 
138 aa  88.2  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1039  protein of unknown function UPF0047  43.96 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  39.47 
 
 
140 aa  87.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0131  hypothetical protein  36.09 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0104  hypothetical protein  36.09 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  40.17 
 
 
138 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1587  hypothetical protein  36.09 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.185989  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  40.17 
 
 
138 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0099  hypothetical protein  36.09 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>