More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2442 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  272  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  77.52 
 
 		 131 aa  223  9e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  64.62 
 
 		 132 aa  191  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  61.94 
 
 		 138 aa  168  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  55.65 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  48.09 
 
 		 133 aa  150  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  48.84 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  51.16 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  57.14 
 
 		 131 aa  150  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  48.8 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  47.33 
 
 		 132 aa  147  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  48.82 
 
 		 132 aa  147  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  48 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  47.2 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  47.24 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  49.18 
 
 		 133 aa  143  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  48.46 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  47.2 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  56.2 
 
 		 133 aa  140  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  48.06 
 
 		 129 aa  140  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  47.15 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  45.74 
 
 		 132 aa  140  8e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  43.51 
 
 		 131 aa  137  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  52.94 
 
 		 131 aa  137  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  52.46 
 
 		 133 aa  138  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  48.44 
 
 		 133 aa  138  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  45.8 
 
 		 143 aa  137  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  49.59 
 
 		 134 aa  137  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  43.08 
 
 		 132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  46.88 
 
 		 133 aa  133  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  45.97 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  45.8 
 
 		 132 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  44.62 
 
 		 133 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  46.32 
 
 		 132 aa  130  7.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  46.09 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  46.09 
 
 		 138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  49.18 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  46.09 
 
 		 132 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  47.62 
 
 		 133 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  46.88 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  45.86 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  45.31 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  46.46 
 
 		 143 aa  123  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  43.08 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  121  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  121  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  41.73 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  44.78 
 
 		 136 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  45.11 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  40.98 
 
 		 134 aa  116  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  44.36 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  42.64 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  42.75 
 
 		 134 aa  113  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  38.21 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  42.28 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  47.57 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  45.63 
 
 		 160 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  39.02 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  33.08 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  42.37 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  44.66 
 
 		 160 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  34.62 
 
 		 134 aa  87.8  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  36.51 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  33.83 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  37.3 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  34.35 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  42.34 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  35.2 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  43.36 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  47.12 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  34.71 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  45.87 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  34.59 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2351  hypothetical protein  47.13 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0140381  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  33.86 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  44.83 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  35.16 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  40.32 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1039  protein of unknown function UPF0047  46.15 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  36.44 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  34.92 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08050  UPF0047 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G02090)  38.64 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.823848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  40.68 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  31.3 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  35.82 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2137  hypothetical protein  39.1 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.435583  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  32.84 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  43.43 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2162  hypothetical protein  43.69 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  38.79 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  44.44 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  36.36 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  36.36 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  37.4 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2136  hypothetical protein  43.69 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  40.95 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  41.44 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>