More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0313 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  320  5e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  65.65 
 
 
131 aa  189  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  55.65 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  56.91 
 
 
132 aa  158  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  51.18 
 
 
132 aa  156  7e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  57.14 
 
 
133 aa  154  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  53.12 
 
 
130 aa  153  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  54.4 
 
 
132 aa  152  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  52.71 
 
 
130 aa  152  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  53.54 
 
 
132 aa  152  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  55.65 
 
 
131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  50.39 
 
 
138 aa  150  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  53.23 
 
 
132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  52.42 
 
 
132 aa  149  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  52.76 
 
 
131 aa  147  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  51.54 
 
 
132 aa  147  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  51.52 
 
 
133 aa  147  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  50.81 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  54.55 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  55.2 
 
 
129 aa  145  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  54.84 
 
 
133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  51.56 
 
 
132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  57.58 
 
 
136 aa  143  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  50.78 
 
 
132 aa  142  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  51.61 
 
 
132 aa  142  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  50.38 
 
 
134 aa  142  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  51.88 
 
 
138 aa  141  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  48.82 
 
 
133 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  56.82 
 
 
139 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  46.88 
 
 
143 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  44.96 
 
 
138 aa  140  9e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  50.78 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  49.57 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  54.1 
 
 
133 aa  138  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  51.2 
 
 
143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  44.96 
 
 
138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  55.3 
 
 
139 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  49.21 
 
 
131 aa  137  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  49.19 
 
 
132 aa  135  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  44.8 
 
 
132 aa  134  4e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  49.61 
 
 
133 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  53.66 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  52.38 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  48.78 
 
 
131 aa  131  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  50.86 
 
 
131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  51.59 
 
 
133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  50.77 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  47.15 
 
 
131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  47.2 
 
 
132 aa  127  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  50.44 
 
 
135 aa  125  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  50.44 
 
 
135 aa  125  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  47.33 
 
 
136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  43.41 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  45.16 
 
 
134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  40.94 
 
 
133 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  46.03 
 
 
130 aa  118  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  42.97 
 
 
128 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  37.12 
 
 
134 aa  102  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  49.59 
 
 
141 aa  97.8  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  38.06 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  41.35 
 
 
131 aa  95.1  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  44.03 
 
 
155 aa  93.6  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  40.94 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  41.94 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  43.8 
 
 
157 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  38.93 
 
 
140 aa  91.3  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  36.23 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  41.67 
 
 
141 aa  90.5  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  42.15 
 
 
160 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  42.15 
 
 
160 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2219  hypothetical protein  44.17 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.457573 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  39.1 
 
 
136 aa  89  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  38.52 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  41.18 
 
 
140 aa  89  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  42.98 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  35.82 
 
 
139 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2128  hypothetical protein  41.13 
 
 
140 aa  88.6  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.594367  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  35.07 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05481  hypothetical protein  36.03 
 
 
151 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.339637  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32835  conserved hypothetical protein  34.43 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.805601  normal  0.755477 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49270  predicted protein  41.96 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  43.27 
 
 
157 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  36.36 
 
 
132 aa  87.4  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  32.12 
 
 
141 aa  87  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05191  hypothetical protein  35.56 
 
 
151 aa  87  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0327196  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1124  hypothetical protein  38.24 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  38.64 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  40.65 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  41.32 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  36.3 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  36.57 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  35.82 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0493  hypothetical protein  34.81 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0896666  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  38.41 
 
 
145 aa  86.3  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  40.16 
 
 
126 aa  85.5  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  34.85 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  42.24 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1467  hypothetical protein  39.84 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2650  hypothetical protein  42.15 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>