More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0727 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  299  7.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  75.38 
 
 		 133 aa  216  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  64.89 
 
 		 133 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  58.91 
 
 		 132 aa  168  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  58.14 
 
 		 132 aa  167  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  57.14 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  56.39 
 
 		 138 aa  156  8e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  54.2 
 
 		 132 aa  153  8e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  49.29 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  52.31 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  54.89 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  52.31 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  51.54 
 
 		 132 aa  150  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  55.04 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  50.39 
 
 		 130 aa  149  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  54.03 
 
 		 129 aa  147  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  51.59 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  53.97 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  55.2 
 
 		 133 aa  144  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  47.69 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  52.76 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  51.54 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  47.58 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  56.03 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  47.69 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  45.38 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  51.54 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  51.2 
 
 		 152 aa  137  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  51.16 
 
 		 131 aa  136  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  46.77 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  45.38 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  48.85 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  45.38 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  53.28 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  52 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  50.76 
 
 		 138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  51.22 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  45.38 
 
 		 133 aa  130  5e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  47.33 
 
 		 133 aa  130  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  47.73 
 
 		 133 aa  130  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  54.24 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  47.69 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  49.21 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  46.56 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  46.46 
 
 		 131 aa  123  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  48.03 
 
 		 130 aa  123  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  42.52 
 
 		 132 aa  123  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  45.16 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  44.88 
 
 		 131 aa  120  8e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  46.15 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  45.38 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  45.38 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  43.86 
 
 		 135 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  43.86 
 
 		 135 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  42.19 
 
 		 134 aa  110  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  40.31 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  45.9 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  47.01 
 
 		 139 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  45.04 
 
 		 137 aa  99.4  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  45.16 
 
 		 138 aa  99.4  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  45.9 
 
 		 141 aa  98.6  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  45.9 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  39.39 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1293  hypothetical protein  45.83 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  40.8 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1039  protein of unknown function UPF0047  51.11 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6559  protein of unknown function UPF0047  44.54 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552252  normal  0.186603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  40.15 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  36.15 
 
 		 138 aa  95.9  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  44.26 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  41.18 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1691  hypothetical protein  41.67 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00156174  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  40.62 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  39.16 
 
 		 160 aa  95.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  38.41 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  41.27 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1893  hypothetical protein  40.52 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.323991 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0493  hypothetical protein  40.15 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0896666  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  43.44 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  41.53 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  42.74 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  38.41 
 
 		 143 aa  94.4  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  32.33 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05191  hypothetical protein  40.15 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0327196  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1152  protein of unknown function UPF0047  41.88 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  hitchhiker  0.00000047058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  39.52 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  41.54 
 
 		 138 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  51.09 
 
 		 139 aa  93.6  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  41.54 
 
 		 138 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  40.8 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  43.59 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  33.83 
 
 		 139 aa  93.6  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  39.84 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  34.81 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  45.08 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0527  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  40.91 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05481  hypothetical protein  40.15 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.339637  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3983  hypothetical protein  39.55 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000552293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  36.84 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>