More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1521 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 
133 aa  281  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  86.47 
 
 
133 aa  251  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  63.08 
 
 
133 aa  189  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  57.25 
 
 
132 aa  175  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  58.33 
 
 
133 aa  169  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  56.92 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  52.34 
 
 
135 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  52.34 
 
 
135 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  50.38 
 
 
132 aa  156  9e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  50.38 
 
 
132 aa  156  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  53.38 
 
 
132 aa  155  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  52.63 
 
 
132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  48.12 
 
 
132 aa  152  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  53.38 
 
 
131 aa  152  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  52.63 
 
 
132 aa  152  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  54.2 
 
 
132 aa  149  8.999999999999999e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  48.85 
 
 
132 aa  149  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  47.73 
 
 
132 aa  146  9e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  47.73 
 
 
132 aa  146  9e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  48.48 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  50.77 
 
 
133 aa  144  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  49.25 
 
 
132 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 
143 aa  143  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  48.85 
 
 
129 aa  142  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  49.22 
 
 
132 aa  142  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  45.86 
 
 
132 aa  141  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  48.46 
 
 
130 aa  141  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  49.23 
 
 
133 aa  140  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  49.62 
 
 
138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  46.92 
 
 
132 aa  137  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  51.13 
 
 
136 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  46.67 
 
 
136 aa  136  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  50.38 
 
 
133 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  50.38 
 
 
139 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  44.7 
 
 
133 aa  134  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  45.8 
 
 
132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  46.88 
 
 
131 aa  133  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  52.38 
 
 
152 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  45.04 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  45.38 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  49.62 
 
 
139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  43.18 
 
 
134 aa  131  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  47.73 
 
 
143 aa  130  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  47.33 
 
 
130 aa  130  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  42.42 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  53.39 
 
 
131 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  46.61 
 
 
131 aa  127  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  46.97 
 
 
138 aa  127  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  44.88 
 
 
131 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  45.74 
 
 
134 aa  127  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  41.98 
 
 
133 aa  125  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  49.21 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  44.62 
 
 
131 aa  122  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  45.11 
 
 
138 aa  120  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  41.67 
 
 
134 aa  115  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  39.53 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  35.34 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  42.4 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  33.59 
 
 
136 aa  87.8  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  40 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  42.4 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  35.07 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  44.9 
 
 
140 aa  84.3  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  38.14 
 
 
160 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  34.38 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  37.4 
 
 
128 aa  84  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  32.84 
 
 
139 aa  84  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  35 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  35.48 
 
 
136 aa  82  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  41.59 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  45.83 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  35.29 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  42.59 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2650  hypothetical protein  40.95 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  37.01 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  43.81 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03880  conserved hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  39.42 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  45.05 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  40.38 
 
 
160 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  32.09 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  33.59 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  35.96 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  40.16 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  38.46 
 
 
160 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0920  protein of unknown function UPF0047  32.84 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  35.96 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5144  hypothetical protein  36.7 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356001  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2219  hypothetical protein  35.46 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.457573 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3367  hypothetical protein  35.96 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00750068  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  43.18 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0527  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  38.26 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  36.7 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2351  hypothetical protein  43.33 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0140381  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  33.09 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  39.05 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  34.35 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  42.86 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  41.9 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>