More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0783 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 
132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  59.23 
 
 
138 aa  175  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  59.85 
 
 
132 aa  173  8e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  61.24 
 
 
130 aa  172  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  59.85 
 
 
132 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  60.61 
 
 
132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  59.23 
 
 
138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  55.3 
 
 
132 aa  169  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  58.14 
 
 
130 aa  167  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  56.15 
 
 
138 aa  163  8e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  57.25 
 
 
133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  56.69 
 
 
131 aa  161  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  53.79 
 
 
132 aa  156  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  52.27 
 
 
131 aa  152  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  51.54 
 
 
129 aa  150  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  52 
 
 
143 aa  150  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  51.54 
 
 
132 aa  149  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  47.33 
 
 
133 aa  148  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  49.61 
 
 
132 aa  149  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  54.62 
 
 
132 aa  148  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  54.33 
 
 
133 aa  147  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  53.39 
 
 
134 aa  147  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  48.85 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  48.12 
 
 
133 aa  143  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  49.62 
 
 
133 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  48.85 
 
 
134 aa  142  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  45.86 
 
 
133 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  49.21 
 
 
133 aa  141  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  46.46 
 
 
130 aa  140  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  47.69 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  46.21 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  44.62 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  46.67 
 
 
136 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  49.23 
 
 
133 aa  137  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  47.33 
 
 
132 aa  136  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  45.74 
 
 
132 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  45.38 
 
 
133 aa  135  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  47.97 
 
 
131 aa  134  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  45.8 
 
 
132 aa  134  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  44.8 
 
 
152 aa  134  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  44.88 
 
 
131 aa  134  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  47.29 
 
 
133 aa  133  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  50.42 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  49.25 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  42.64 
 
 
131 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  49.61 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  49.61 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  43.51 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  43.51 
 
 
132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  41.73 
 
 
131 aa  120  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  120  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  38.52 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  43.31 
 
 
128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  41.54 
 
 
136 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  40.77 
 
 
139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  41.54 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  40.77 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  43.18 
 
 
130 aa  106  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  39.68 
 
 
130 aa  101  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  45.38 
 
 
138 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  45.38 
 
 
138 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  38.76 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  45.95 
 
 
137 aa  97.8  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  46.67 
 
 
137 aa  96.7  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  34.11 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  38.76 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  39.37 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  39.37 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  42.86 
 
 
138 aa  94.4  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  37.98 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  40.5 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  43.33 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  36.92 
 
 
128 aa  93.2  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0078  hypothetical protein  39.23 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3095  hypothetical protein  39.34 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0121064  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0833  hypothetical protein  37.98 
 
 
139 aa  92  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236299  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  40.95 
 
 
160 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  37.1 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  36.72 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  36 
 
 
137 aa  91.3  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  40 
 
 
160 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  34.09 
 
 
131 aa  91.3  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  38.71 
 
 
136 aa  90.9  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  38.58 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  39.52 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  37.6 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0920  protein of unknown function UPF0047  35.66 
 
 
139 aa  90.1  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  40.83 
 
 
138 aa  90.1  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2109  protein of unknown function UPF0047  36.29 
 
 
138 aa  90.1  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0609464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  38.05 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  39.2 
 
 
140 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  38.58 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  36.8 
 
 
136 aa  88.6  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  39.32 
 
 
136 aa  89  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  37.01 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  43.81 
 
 
157 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  40 
 
 
138 aa  87.8  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  35.2 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  35.16 
 
 
138 aa  87.4  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  41.75 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>