More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0655 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  278  2e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  80.3 
 
 
132 aa  229  8.000000000000001e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  79.41 
 
 
136 aa  224  2e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  80.88 
 
 
136 aa  223  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  50.71 
 
 
143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  48.91 
 
 
137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  46.72 
 
 
137 aa  131  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  39.71 
 
 
137 aa  110  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  40.46 
 
 
132 aa  105  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  42.11 
 
 
133 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  38.69 
 
 
137 aa  104  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  37.4 
 
 
132 aa  103  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  41.98 
 
 
133 aa  103  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  41.09 
 
 
132 aa  102  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  36.03 
 
 
136 aa  102  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  40.16 
 
 
133 aa  100  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  41.73 
 
 
134 aa  100  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  42.74 
 
 
131 aa  99.8  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  41.41 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  35.16 
 
 
132 aa  99.4  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  35.11 
 
 
132 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  37.23 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  36.03 
 
 
136 aa  99.4  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  35.11 
 
 
132 aa  98.6  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  40.32 
 
 
128 aa  98.6  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  37.69 
 
 
131 aa  97.4  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  35.11 
 
 
132 aa  97.1  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  34.88 
 
 
132 aa  96.7  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  39.69 
 
 
131 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  38.93 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  36.76 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  37.4 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  34.35 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  34.31 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  37.69 
 
 
130 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  39.55 
 
 
142 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  38.35 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  36.92 
 
 
133 aa  93.2  9e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  41.09 
 
 
132 aa  93.6  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  36.23 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  37.59 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  42.52 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  36.55 
 
 
145 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  36.72 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  36.23 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  37.1 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  37.8 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  35.66 
 
 
134 aa  90.9  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  31.82 
 
 
132 aa  90.9  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40920  predicted protein  35.97 
 
 
184 aa  90.9  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  39.55 
 
 
160 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  44.35 
 
 
126 aa  90.5  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  34.06 
 
 
138 aa  90.9  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  38.35 
 
 
141 aa  90.1  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1445  hypothetical protein  35.51 
 
 
138 aa  90.1  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0875053  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  36.76 
 
 
137 aa  88.6  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  35.81 
 
 
145 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2109  protein of unknown function UPF0047  35.51 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0609464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  38.57 
 
 
142 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  37.59 
 
 
138 aa  88.2  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  35.97 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  34.06 
 
 
138 aa  87.8  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  34.07 
 
 
134 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  34.88 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  35.97 
 
 
139 aa  87.4  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  34.53 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.88 
 
 
584 aa  85.9  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  39.37 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  34.38 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  36.3 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  35.16 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  33.83 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  37.72 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  39.66 
 
 
131 aa  85.9  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1088  protein of unknown function UPF0047  40 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.977912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  35.88 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  39.52 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3072  hypothetical protein  35.51 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1410  hypothetical protein  35.25 
 
 
139 aa  84.3  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  33.81 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3284  protein of unknown function UPF0047  32.61 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2329  hypothetical protein  35.97 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561757  normal  0.383888 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0920  protein of unknown function UPF0047  34.53 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  34.03 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  37.7 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  33.59 
 
 
138 aa  84  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  36.5 
 
 
138 aa  84  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  32.84 
 
 
133 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  33.08 
 
 
133 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  34.92 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0976  protein of unknown function UPF0047  31.88 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.394936  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0254  protein of unknown function UPF0047  35.71 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  33.81 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  34.13 
 
 
133 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1152  hypothetical protein  35.25 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  35.34 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  32.81 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>