295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0570 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  289  8e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2109  protein of unknown function UPF0047  85.51 
 
 		 138 aa  256  8e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0609464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  86.96 
 
 		 138 aa  254  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3072  hypothetical protein  85.51 
 
 		 138 aa  252  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1191  hypothetical protein  84.17 
 
 		 139 aa  243  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1152  hypothetical protein  81.29 
 
 		 139 aa  241  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2666  protein of unknown function UPF0047  83.33 
 
 		 138 aa  241  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2183  hypothetical protein  82.01 
 
 		 139 aa  239  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  76.09 
 
 		 138 aa  237  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2363  hypothetical protein  81.29 
 
 		 139 aa  236  6.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100491  normal  0.704799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3230  hypothetical protein  78.42 
 
 		 139 aa  236  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1065  hypothetical protein  78.99 
 
 		 138 aa  234  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00346486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3634  protein of unknown function UPF0047  80.58 
 
 		 139 aa  233  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0515  protein of unknown function UPF0047  77.54 
 
 		 138 aa  232  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0221734  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0225  hypothetical protein  78.42 
 
 		 139 aa  231  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0225  hypothetical protein  77.7 
 
 		 139 aa  231  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3409  hypothetical protein  79.86 
 
 		 139 aa  229  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000525529  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2329  hypothetical protein  78.42 
 
 		 157 aa  228  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561757  normal  0.383888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3144  hypothetical protein  79.86 
 
 		 139 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  73.91 
 
 		 138 aa  226  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1739  protein of unknown function UPF0047  76.81 
 
 		 138 aa  224  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1685  hypothetical protein  76.26 
 
 		 139 aa  222  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2359  protein of unknown function UPF0047  76.09 
 
 		 138 aa  220  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1410  hypothetical protein  76.98 
 
 		 139 aa  219  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  72.66 
 
 		 139 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0955  protein of unknown function UPF0047  77.7 
 
 		 139 aa  219  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0812583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  73.91 
 
 		 584 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1956  hypothetical protein  74.1 
 
 		 139 aa  219  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0266366  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  72.46 
 
 		 138 aa  218  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  75.54 
 
 		 139 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0833  hypothetical protein  75.54 
 
 		 139 aa  216  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236299  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  71.94 
 
 		 139 aa  216  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  71.01 
 
 		 138 aa  215  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0111  hypothetical protein  69.78 
 
 		 150 aa  215  2e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000308533 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2631  hypothetical protein  74.64 
 
 		 138 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  71.74 
 
 		 138 aa  214  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0976  protein of unknown function UPF0047  72.46 
 
 		 138 aa  213  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.394936  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0920  protein of unknown function UPF0047  74.1 
 
 		 139 aa  213  5.9999999999999996e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1520  protein of unknown function UPF0047  74.1 
 
 		 139 aa  213  8e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0913014  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  70.5 
 
 		 139 aa  212  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  69.78 
 
 		 139 aa  211  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3284  protein of unknown function UPF0047  71.01 
 
 		 138 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2106  hypothetical protein  72.99 
 
 		 138 aa  210  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1344  hypothetical protein  71.74 
 
 		 138 aa  208  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0254  protein of unknown function UPF0047  72.14 
 
 		 140 aa  206  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1445  hypothetical protein  61.87 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0875053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22360  hypothetical protein  77.89 
 
 		 95 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  51.45 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  53.79 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  54.68 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  52.55 
 
 		 137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  52.9 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  51.45 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  46.76 
 
 		 137 aa  143  9e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  38.13 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  37.4 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  41.35 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  38.13 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  40.83 
 
 		 132 aa  90.1  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  36.64 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  35 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  37.12 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  34.68 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  38.1 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  34.06 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  35.61 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  33.81 
 
 		 137 aa  85.9  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  35.54 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  34.85 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  35.11 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  37.3 
 
 		 141 aa  84.3  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  38.4 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  36.88 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  33.09 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  35.38 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  36 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1088  protein of unknown function UPF0047  32.85 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.977912 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  36.13 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  34.92 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  37.5 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  33.83 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  34.09 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  32.82 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  38.71 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  34.15 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  34.65 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  33.8 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  34.53 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  34.06 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  35.94 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  34.53 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  32.09 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  30.6 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  34.92 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  33.85 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  36.13 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  34.43 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  29.37 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>