299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2645 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 
133 aa  280  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  86.47 
 
 
133 aa  251  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  60.61 
 
 
132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  60 
 
 
133 aa  179  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  58.02 
 
 
133 aa  169  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  56.25 
 
 
135 aa  167  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  56.25 
 
 
135 aa  166  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  56.15 
 
 
130 aa  158  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  49.62 
 
 
132 aa  152  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  50 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  51.88 
 
 
132 aa  150  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  47.37 
 
 
132 aa  149  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  51.13 
 
 
132 aa  149  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  48.09 
 
 
132 aa  147  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  47.37 
 
 
132 aa  147  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  53.08 
 
 
131 aa  147  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  49.21 
 
 
143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  48.09 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  50.77 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  48.87 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  48.12 
 
 
132 aa  143  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  51.49 
 
 
132 aa  142  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  46.56 
 
 
132 aa  142  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  49.24 
 
 
132 aa  142  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  50 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  49.23 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  51.91 
 
 
133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  48.82 
 
 
129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  49.22 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  46.15 
 
 
133 aa  135  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  44.7 
 
 
132 aa  131  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  51.59 
 
 
152 aa  131  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  42.42 
 
 
133 aa  130  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  44.62 
 
 
138 aa  130  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  47.33 
 
 
143 aa  130  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  45.19 
 
 
136 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  41.98 
 
 
134 aa  130  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  43.94 
 
 
132 aa  129  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  43.51 
 
 
133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  52.5 
 
 
131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  43.08 
 
 
132 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  47.01 
 
 
136 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  43.94 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  45.93 
 
 
139 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  46.56 
 
 
138 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  44.27 
 
 
131 aa  123  9e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  49.22 
 
 
133 aa  122  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  45.52 
 
 
139 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  43.08 
 
 
131 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  44.19 
 
 
134 aa  120  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  44.07 
 
 
131 aa  120  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  41.73 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  43.61 
 
 
138 aa  117  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  40.68 
 
 
130 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  42.62 
 
 
128 aa  98.6  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  34.33 
 
 
143 aa  90.5  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  38.76 
 
 
134 aa  90.1  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  41.32 
 
 
137 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  43 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  34.81 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  30.83 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  36.64 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  38.89 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  36.97 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  41.9 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  34.07 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  44.79 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  32.82 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03880  conserved hypothetical protein  39.09 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  40.71 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  37.27 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1124  hypothetical protein  36.69 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  43.62 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  36.36 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2650  hypothetical protein  33.82 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  34.11 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0485  hypothetical protein  40.82 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361267  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3740  hypothetical protein  42.86 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.597829  hitchhiker  0.000337865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  38.18 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  33.08 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  33.08 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  32.59 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3983  hypothetical protein  32.12 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000552293  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  31.11 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  36.15 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  39.29 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  33.04 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  36.29 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  35.38 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1152  protein of unknown function UPF0047  37.59 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  hitchhiker  0.00000047058 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  36.44 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2118  protein of unknown function UPF0047  32.59 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2219  hypothetical protein  38.28 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.457573 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  33.08 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0527  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  39.32 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  41.76 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  42.05 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1102  hypothetical protein  35.48 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>