More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0339 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 
137 aa  282  8e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  58.09 
 
 
143 aa  175  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  52.55 
 
 
137 aa  156  8e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  52.63 
 
 
132 aa  137  6e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  53.23 
 
 
136 aa  135  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  48.18 
 
 
136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  46.72 
 
 
139 aa  131  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  49.22 
 
 
131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  45.38 
 
 
130 aa  115  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  40.71 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  39.71 
 
 
138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  39.29 
 
 
148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  39.67 
 
 
134 aa  107  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  42.11 
 
 
161 aa  105  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  39.01 
 
 
160 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  38.13 
 
 
138 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  38.3 
 
 
142 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  41.98 
 
 
133 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  41.35 
 
 
141 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  39.2 
 
 
134 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  38.76 
 
 
132 aa  102  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  36.64 
 
 
133 aa  101  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  39.42 
 
 
136 aa  100  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  39.29 
 
 
142 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  37.23 
 
 
136 aa  100  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  37.21 
 
 
133 aa  100  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0833  hypothetical protein  37.86 
 
 
139 aa  100  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236299  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  37.98 
 
 
141 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  35 
 
 
141 aa  99.4  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  38.57 
 
 
141 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  38.21 
 
 
133 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  34.48 
 
 
146 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  35.88 
 
 
130 aa  97.8  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  97.4  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  37.23 
 
 
137 aa  97.4  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  40.8 
 
 
128 aa  97.1  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  38.57 
 
 
137 aa  96.7  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  34.11 
 
 
132 aa  96.7  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  35.04 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  36.43 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  36.88 
 
 
141 aa  96.7  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  36.43 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2666  protein of unknown function UPF0047  35.97 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  36.69 
 
 
138 aa  94.7  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  34.11 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  38.58 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2109  protein of unknown function UPF0047  37.41 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0609464 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  37.5 
 
 
133 aa  94  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  39.86 
 
 
139 aa  94  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0515  protein of unknown function UPF0047  35.97 
 
 
138 aa  94  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0221734  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  41.46 
 
 
126 aa  93.6  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1445  hypothetical protein  34.53 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0875053  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  36.64 
 
 
133 aa  93.6  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  35.48 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  29.71 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  34.43 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  36.69 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  35.97 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3072  hypothetical protein  35.97 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0920  protein of unknown function UPF0047  36.43 
 
 
139 aa  92  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1685  hypothetical protein  37.86 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  35.71 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  36.69 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.97 
 
 
584 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  36.76 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  35.25 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  34.93 
 
 
145 aa  90.5  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  36.43 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  34.11 
 
 
138 aa  90.1  9e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  35.25 
 
 
145 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2183  hypothetical protein  36.43 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  34.11 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  33.58 
 
 
137 aa  89.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2106  hypothetical protein  35.51 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40920  predicted protein  33.57 
 
 
184 aa  90.1  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1410  hypothetical protein  37.14 
 
 
139 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  32.8 
 
 
130 aa  88.6  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  36.43 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1344  hypothetical protein  35.97 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  39.34 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3634  protein of unknown function UPF0047  34.29 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2359  protein of unknown function UPF0047  33.81 
 
 
138 aa  87.8  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  37.01 
 
 
129 aa  87.8  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  32.84 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  35.94 
 
 
132 aa  87  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  38.52 
 
 
132 aa  87  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2329  hypothetical protein  33.57 
 
 
157 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561757  normal  0.383888 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  31.01 
 
 
138 aa  86.7  9e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2363  hypothetical protein  34.29 
 
 
139 aa  86.7  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100491  normal  0.704799 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1520  protein of unknown function UPF0047  34.29 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0913014  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1152  hypothetical protein  35 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  34.96 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  33.81 
 
 
138 aa  85.9  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  35.43 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  33.58 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0225  hypothetical protein  33.57 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1739  protein of unknown function UPF0047  34.53 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  35 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>