More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0551 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  284  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  99.26 
 
 
135 aa  282  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  56.25 
 
 
133 aa  166  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  55.73 
 
 
133 aa  163  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  52.34 
 
 
133 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  52.27 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  50.81 
 
 
133 aa  148  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  51.52 
 
 
132 aa  146  9e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  46.97 
 
 
131 aa  143  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  51.18 
 
 
130 aa  143  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  50.38 
 
 
132 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  50.4 
 
 
132 aa  141  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  50.38 
 
 
132 aa  140  7e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  51.54 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  49.62 
 
 
132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  53.12 
 
 
143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  49.58 
 
 
132 aa  138  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  49.23 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  46.83 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  54.39 
 
 
132 aa  137  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  46.83 
 
 
129 aa  134  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  43.75 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  53.1 
 
 
130 aa  131  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  45.74 
 
 
136 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  45.67 
 
 
132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  50 
 
 
132 aa  130  6.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  49.61 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  45.53 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  49.15 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  47.2 
 
 
139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  46.4 
 
 
136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  44 
 
 
130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  49.57 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  50.44 
 
 
152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  48.09 
 
 
132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  44.96 
 
 
133 aa  124  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  44.8 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  48.33 
 
 
131 aa  124  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  41.22 
 
 
134 aa  124  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  42.75 
 
 
138 aa  123  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  42.97 
 
 
131 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  44 
 
 
139 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  48.7 
 
 
138 aa  121  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  43.61 
 
 
133 aa  121  4e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  42.86 
 
 
131 aa  121  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  44.96 
 
 
131 aa  120  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  35.34 
 
 
133 aa  118  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  40.8 
 
 
132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  41.6 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  41.98 
 
 
138 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  40.15 
 
 
134 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  40.8 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  39.68 
 
 
131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  43.59 
 
 
134 aa  114  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  43.86 
 
 
143 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  43.59 
 
 
130 aa  103  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  43.97 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  46.53 
 
 
140 aa  87.4  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  33.86 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  34.81 
 
 
146 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  32.56 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  33.59 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  34.85 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  32.81 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0485  hypothetical protein  40.57 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361267  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  31.75 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  33.06 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  33.06 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  34.68 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  31.54 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  42.11 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  33.06 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  32.58 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  33.05 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  32.81 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2359  protein of unknown function UPF0047  32.85 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  31.15 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  30.83 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  30.37 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  32.8 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  32.2 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  41.76 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  36.27 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1587  hypothetical protein  29.17 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.185989  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0131  hypothetical protein  29.17 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0099  hypothetical protein  29.17 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0104  hypothetical protein  29.17 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1124  hypothetical protein  33.02 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  36.28 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  34.38 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  33.01 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  32.69 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  33.01 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  35.51 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3367  hypothetical protein  33.01 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00750068  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03880  conserved hypothetical protein  36.54 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  30.53 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1893  hypothetical protein  41 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.323991 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5144  hypothetical protein  33.93 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356001  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40920  predicted protein  30.37 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>