More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2505 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 		 131 aa  270  6e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  77.52 
 
 		 131 aa  223  9e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  61.07 
 
 		 132 aa  183  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  57.78 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  51.54 
 
 		 133 aa  158  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  51.91 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  51.91 
 
 		 132 aa  157  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  58.91 
 
 		 133 aa  156  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  52.76 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  50.39 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  51.16 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  48.84 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  57.14 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  48.06 
 
 		 132 aa  149  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  49.61 
 
 		 132 aa  147  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  52.76 
 
 		 152 aa  147  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  48.36 
 
 		 133 aa  146  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  47.2 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  49.61 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  47.2 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  47.2 
 
 		 132 aa  145  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  47.33 
 
 		 132 aa  143  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  54.47 
 
 		 133 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  46.56 
 
 		 132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  43.51 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  47.97 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  44.09 
 
 		 143 aa  140  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  47.66 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  43.41 
 
 		 131 aa  137  6e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  46.46 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  42.75 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  50.39 
 
 		 132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  45.38 
 
 		 134 aa  133  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  49.6 
 
 		 131 aa  133  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  49.61 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  48.06 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  46.03 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  46.15 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  49.58 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  42.64 
 
 		 132 aa  130  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  44.44 
 
 		 138 aa  130  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  45.24 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  42.42 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  47.76 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  43.94 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  48.48 
 
 		 134 aa  123  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  45.16 
 
 		 143 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  42.97 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  42.97 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  44.09 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  48.82 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  47.69 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  43.09 
 
 		 134 aa  120  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  47.24 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  39.68 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  40.16 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  40.94 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  39.69 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  34.35 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  40.8 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  37.98 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  37.3 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  41.32 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  38.28 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  37.3 
 
 		 140 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  34.62 
 
 		 143 aa  85.9  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  36.51 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  39.83 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  35.94 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  38.98 
 
 		 160 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  36.09 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  36.09 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  34.68 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  39.68 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1039  protein of unknown function UPF0047  44.86 
 
 		 141 aa  83.6  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  32.23 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  39.37 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  39.64 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  43.22 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  35.66 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  41.53 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  37.01 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  38.98 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  40.68 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  39.06 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  35.11 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  31.78 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  37.7 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  44.25 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  39.66 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  36.23 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05481  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.339637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2351  hypothetical protein  43.68 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0140381  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  32.82 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  35.71 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  38.79 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  37.29 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0493  hypothetical protein  33.08 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  39.53 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32835  conserved hypothetical protein  34.85 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.805601  normal  0.755477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>