More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0129 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  282  9e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  85.4 
 
 		 138 aa  246  8e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  83.94 
 
 		 138 aa  237  5e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  59.23 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  60.94 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  55.04 
 
 		 130 aa  168  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  62.99 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  57.69 
 
 		 132 aa  161  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  57.69 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  53.08 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  55.38 
 
 		 131 aa  160  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  56.39 
 
 		 133 aa  158  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  56.39 
 
 		 143 aa  156  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  54.62 
 
 		 133 aa  156  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  49.24 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  51.91 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  53.44 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  54.84 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  49.62 
 
 		 132 aa  153  7e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  51.94 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  50.39 
 
 		 152 aa  150  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  51.16 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  53.12 
 
 		 134 aa  148  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  53.12 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  53.49 
 
 		 136 aa  141  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  52.07 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  46.83 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  45.8 
 
 		 134 aa  140  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  44.96 
 
 		 133 aa  140  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  49.61 
 
 		 133 aa  140  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  46.88 
 
 		 133 aa  140  7e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  49.62 
 
 		 133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  46.15 
 
 		 133 aa  138  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  46.92 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  48.78 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  48.46 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  46.56 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  45.8 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  45.8 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  44.19 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  52.59 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  48.03 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  46.03 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  42.86 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  50.39 
 
 		 132 aa  130  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  44.19 
 
 		 131 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  48.48 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  46.09 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  48.06 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  49.57 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  49.57 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  46.51 
 
 		 139 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  44.36 
 
 		 138 aa  124  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  43.94 
 
 		 134 aa  123  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  44.19 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  42.4 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  38.64 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  45.71 
 
 		 137 aa  103  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49270  predicted protein  52.29 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  35.88 
 
 		 134 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  40.31 
 
 		 130 aa  98.6  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1691  hypothetical protein  42.42 
 
 		 138 aa  97.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00156174  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  43.33 
 
 		 160 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  43.33 
 
 		 138 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  43.33 
 
 		 138 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  43.33 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  44.76 
 
 		 137 aa  97.1  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  43.33 
 
 		 160 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  40.83 
 
 		 139 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1688  hypothetical protein  36.36 
 
 		 195 aa  97.1  8e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  44.44 
 
 		 148 aa  96.7  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  43.75 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  44.17 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1542  protein of unknown function UPF0047  39.73 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  49.11 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  42.86 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  41.94 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  44.12 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  45.63 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  44.44 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  47.62 
 
 		 157 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  42.74 
 
 		 157 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  36.09 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  38.46 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  46.73 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07151  hypothetical protein  38.56 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3072  hypothetical protein  34.09 
 
 		 138 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0078  hypothetical protein  38.57 
 
 		 149 aa  90.1  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  35.77 
 
 		 139 aa  90.1  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  37.4 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  35.04 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1293  hypothetical protein  39.47 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2128  hypothetical protein  37.41 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.594367  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  36.07 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6559  protein of unknown function UPF0047  45.71 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552252  normal  0.186603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  43.69 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0920  protein of unknown function UPF0047  33.08 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0674  hypothetical protein  35.61 
 
 		 205 aa  88.6  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.798458  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03880  conserved hypothetical protein  49.43 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>