More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1649 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  331  2e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  54.55 
 
 
138 aa  155  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  53.24 
 
 
161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  53.17 
 
 
137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  48.55 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  51.54 
 
 
138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1088  protein of unknown function UPF0047  42.75 
 
 
139 aa  138  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.977912 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  45.93 
 
 
138 aa  138  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  48.84 
 
 
136 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  46.46 
 
 
139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  42.96 
 
 
134 aa  105  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  35.56 
 
 
143 aa  101  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  37.88 
 
 
130 aa  99.4  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  46.15 
 
 
128 aa  97.8  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  37.59 
 
 
131 aa  97.4  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  32.85 
 
 
137 aa  95.5  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  34.31 
 
 
137 aa  95.1  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  37.31 
 
 
137 aa  94  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  36.49 
 
 
132 aa  94  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  36.09 
 
 
143 aa  94  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  34.07 
 
 
137 aa  92.8  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  36.36 
 
 
145 aa  90.9  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  38.52 
 
 
131 aa  90.1  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  36.11 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  33.56 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  38.93 
 
 
129 aa  89  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  38.35 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  37.78 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  40.15 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  31.85 
 
 
136 aa  88.2  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  39.84 
 
 
136 aa  88.2  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  32.41 
 
 
145 aa  88.6  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  31.82 
 
 
138 aa  87.8  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  33.82 
 
 
136 aa  87.4  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  33.09 
 
 
132 aa  87  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  32.35 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  32.35 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  38.06 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  35.34 
 
 
133 aa  86.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  33.08 
 
 
132 aa  87  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  36.09 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  38.1 
 
 
130 aa  86.3  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  34.88 
 
 
132 aa  85.5  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  35.43 
 
 
132 aa  85.5  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  34.85 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  33.87 
 
 
138 aa  84.7  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  34.15 
 
 
137 aa  84.3  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  30.6 
 
 
137 aa  84.3  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1685  hypothetical protein  36.29 
 
 
139 aa  84  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  32.33 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  33.83 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  31.5 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  35.54 
 
 
133 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  37.8 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  32.61 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  34.35 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  36.15 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  36.72 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  33.58 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  34.29 
 
 
140 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  34.59 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  30.66 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  34.4 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  32.58 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  37.01 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  30.82 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  35.16 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  37.7 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  34.31 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  33.83 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  31.45 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  30.3 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  33.61 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  35.11 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0254  protein of unknown function UPF0047  31.16 
 
 
140 aa  80.5  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0515  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 
138 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0221734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3144  hypothetical protein  34.09 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  35.04 
 
 
136 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  31.82 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1344  hypothetical protein  31.62 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.06 
 
 
584 aa  79  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  30.3 
 
 
139 aa  79  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  34.68 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  30.08 
 
 
138 aa  79  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1956  hypothetical protein  30.3 
 
 
139 aa  79  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0266366  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  33.88 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3634  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  33.58 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0976  protein of unknown function UPF0047  31.82 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.394936  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  35.88 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  34.59 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  32.52 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  29.71 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40920  predicted protein  35 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1410  hypothetical protein  34.43 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3409  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000525529  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3395  hypothetical protein  32.12 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.465123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>