More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1088 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1088  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 		 139 aa  284  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.977912 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  42.75 
 
 		 161 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  43.48 
 
 		 138 aa  130  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  45.93 
 
 		 140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  42.42 
 
 		 136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  43.7 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  41.73 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  40.3 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  43.08 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  38.69 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2359  protein of unknown function UPF0047  34.31 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  32.85 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1344  hypothetical protein  34.31 
 
 		 138 aa  87.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  32.59 
 
 		 143 aa  87.4  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  34.06 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1152  hypothetical protein  33.81 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  33.09 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  34.11 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3284  protein of unknown function UPF0047  33.09 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  33.81 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  33.82 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  33.09 
 
 		 139 aa  84.7  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  32.85 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  28.47 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0976  protein of unknown function UPF0047  31.62 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.394936  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  29.93 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1739  protein of unknown function UPF0047  32.12 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.62 
 
 		 584 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2363  hypothetical protein  33.09 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100491  normal  0.704799 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0515  protein of unknown function UPF0047  33.88 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0221734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  32.85 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  29.93 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1410  hypothetical protein  38.28 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2106  hypothetical protein  32.35 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0920  protein of unknown function UPF0047  31.88 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  34.85 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2109  protein of unknown function UPF0047  32.12 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0609464 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  35.88 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2183  hypothetical protein  32.37 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  30.15 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  31.85 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  35.34 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3634  protein of unknown function UPF0047  34.53 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  32.35 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  34.35 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3072  hypothetical protein  31.39 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1956  hypothetical protein  30.94 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0266366  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0254  protein of unknown function UPF0047  34.96 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0225  hypothetical protein  31.65 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  34.43 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  35.04 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0225  hypothetical protein  30.94 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2329  hypothetical protein  32.37 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561757  normal  0.383888 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  33.58 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1685  hypothetical protein  30.94 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0833  hypothetical protein  32.37 
 
 		 139 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236299  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  34.43 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2631  hypothetical protein  29.41 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1520  protein of unknown function UPF0047  30.43 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0913014  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3144  hypothetical protein  33.81 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  28.68 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  31.06 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3230  hypothetical protein  30.94 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  33.85 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  29.1 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2666  protein of unknown function UPF0047  31.39 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1191  hypothetical protein  30.94 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0955  protein of unknown function UPF0047  34.4 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0812583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  29.85 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  29.2 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  32.82 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  30.22 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  28.57 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1445  hypothetical protein  29.2 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0875053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  30.22 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  29.32 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  29.85 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  32.52 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3409  hypothetical protein  30.94 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000525529  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  32.33 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  32.33 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  28.78 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  31.62 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  29.32 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  31.67 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  29.79 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  29.85 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  31.58 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1065  hypothetical protein  34.43 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00346486  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  30 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  31.58 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  32.33 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  30.6 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  29.01 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  28.68 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  29.41 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  29.41 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  29.55 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>