More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1631 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  283  5e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  65.44 
 
 
137 aa  185  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  61.65 
 
 
161 aa  169  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  59.26 
 
 
136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  45.93 
 
 
161 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  45.99 
 
 
138 aa  123  7e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  46.72 
 
 
139 aa  122  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1088  protein of unknown function UPF0047  38.69 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.977912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  42.11 
 
 
140 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  40.46 
 
 
138 aa  100  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  40.6 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  42.86 
 
 
133 aa  99  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  38.41 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  39.01 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  36.57 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  37.5 
 
 
132 aa  90.9  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  90.1  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  37.59 
 
 
139 aa  88.2  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  36.76 
 
 
137 aa  88.2  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2351  hypothetical protein  42.4 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0140381  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  37.59 
 
 
131 aa  87.4  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  33.82 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  38.81 
 
 
133 aa  87  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  39.13 
 
 
132 aa  87  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  34.81 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  37.59 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  36.09 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  39.53 
 
 
128 aa  84.7  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  34.33 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  35.82 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  36.69 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  38.46 
 
 
145 aa  84  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  36.84 
 
 
132 aa  84  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  37.31 
 
 
137 aa  83.6  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  34.97 
 
 
159 aa  83.6  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  36.3 
 
 
141 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  34.97 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  36.88 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  38.33 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  35.48 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  41.8 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  33.58 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4360  hypothetical protein  35.25 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  34.72 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  32.82 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0559  hypothetical protein  36.69 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  36.09 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  36.67 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  35.04 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  31.65 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  32.41 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  38.28 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2650  hypothetical protein  39.34 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  32.35 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  38.71 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  41.51 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1102  hypothetical protein  32.85 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  30.66 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  36.03 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2358  hypothetical protein  39.68 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0335235  normal  0.0190831 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  36.29 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  35.04 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  38.46 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  45.19 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3409  hypothetical protein  33.09 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000525529  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  32.37 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  35.04 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  35.04 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  34.31 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1893  hypothetical protein  35 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.323991 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  37.78 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2329  hypothetical protein  33.81 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561757  normal  0.383888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1956  hypothetical protein  31.16 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0266366  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  36 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6559  protein of unknown function UPF0047  37.59 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552252  normal  0.186603 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  38.14 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  36.3 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3367  hypothetical protein  36.3 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00750068  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  36.3 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  39.67 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  32.62 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1191  hypothetical protein  32.37 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3764  hypothetical protein  37.69 
 
 
136 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.434678 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32835  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 
147 aa  77  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.805601  normal  0.755477 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0254  protein of unknown function UPF0047  35.48 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  32.58 
 
 
137 aa  77  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  35.82 
 
 
141 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  38.35 
 
 
160 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  37.1 
 
 
132 aa  77  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  33.08 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2109  protein of unknown function UPF0047  34.81 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0609464 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12577  hypothetical protein  37.59 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0908128 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  37.14 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  32.37 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  38.26 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5559  conserved hypothetical protein TIGR00149  33.33 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.484103  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2889  hypothetical protein  36.3 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  35.29 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>