More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1415 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  273  6e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  65.44 
 
 		 138 aa  185  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  67.94 
 
 		 161 aa  184  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  62.22 
 
 		 136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  53.17 
 
 		 161 aa  146  8e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  48.53 
 
 		 138 aa  140  8e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  48.15 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 		 138 aa  121  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1088  protein of unknown function UPF0047  40.3 
 
 		 139 aa  120  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.977912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  42.24 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  40.46 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  39.53 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  35.07 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  36.84 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  42.11 
 
 		 128 aa  87.4  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  35.88 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  32.06 
 
 		 138 aa  84.3  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  36.89 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  35.61 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  37.6 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  37.21 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1966  hypothetical protein  38.24 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387815  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  35.61 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  36.13 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  41.04 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  36.84 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  36.36 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  34.85 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  43.36 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  33.58 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  33.08 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  36.09 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  36.64 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  37.12 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  35.07 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  33.82 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  36.61 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  35.25 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  36 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  34.19 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  35.04 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7042  protein of unknown function UPF0047  38.81 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  33.83 
 
 		 132 aa  76.6  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3764  hypothetical protein  39.26 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.434678 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  37.8 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  34.31 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  34.56 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22490  conserved hypothetical protein TIGR00149  37.78 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.282378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  30.15 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  39.62 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  36.84 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  35.07 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  28.03 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  39.37 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  34.38 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  33.61 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  32.58 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  29.41 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2358  hypothetical protein  37.4 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0335235  normal  0.0190831 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  30.53 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3395  hypothetical protein  34.62 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  35 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2945  protein of unknown function UPF0047  38.97 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  29.41 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  30.15 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1646  protein of unknown function UPF0047  40.3 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1956  hypothetical protein  30.37 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0266366  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  39.42 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1152  hypothetical protein  35.96 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  34.85 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  37.4 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  36.72 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  35.65 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2386  hypothetical protein  38.76 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2345  hypothetical protein  38.76 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.202939  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  35.45 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2392  hypothetical protein  38.76 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  36.59 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  34.81 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  34.15 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  35.11 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0539  protein of unknown function UPF0047  35.04 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  31.62 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  39.84 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  30.3 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1191  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  37.61 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  37.61 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0254  protein of unknown function UPF0047  35.54 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  36.13 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  36.13 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  31.11 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5144  hypothetical protein  36.97 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3367  hypothetical protein  36.13 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00750068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  32.17 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0920  protein of unknown function UPF0047  35.34 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1363  protein of unknown function UPF0047  40.71 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>