224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1966 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1966  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  287  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387815  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7042  protein of unknown function UPF0047  70.9 
 
 		 135 aa  206  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2358  hypothetical protein  70.15 
 
 		 135 aa  201  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0335235  normal  0.0190831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2945  protein of unknown function UPF0047  77.04 
 
 		 135 aa  196  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1646  protein of unknown function UPF0047  73.13 
 
 		 135 aa  194  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314568  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22490  conserved hypothetical protein TIGR00149  63.91 
 
 		 155 aa  177  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.282378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3395  hypothetical protein  61.19 
 
 		 140 aa  174  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3612  hypothetical protein  60.9 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1363  protein of unknown function UPF0047  58.65 
 
 		 134 aa  164  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3056  hypothetical protein  69.92 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3372  hypothetical protein  58.65 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5843  protein of unknown function UPF0047  62.41 
 
 		 135 aa  157  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228828  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2870  hypothetical protein  63.16 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142366  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1861  hypothetical protein  65.62 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0103013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10190  conserved hypothetical protein TIGR00149  59.7 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2345  hypothetical protein  55.64 
 
 		 133 aa  144  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.202939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2392  hypothetical protein  55.64 
 
 		 133 aa  144  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2386  hypothetical protein  55.64 
 
 		 133 aa  144  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3764  hypothetical protein  52.94 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.434678 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1034  hypothetical protein  52.24 
 
 		 133 aa  140  8e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0183321 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12577  hypothetical protein  56.78 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0908128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2639  hypothetical protein  52.85 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0539  protein of unknown function UPF0047  51.16 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0880  protein of unknown function UPF0047  43.7 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  38.24 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  36.23 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  33.83 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  35.59 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  42.74 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  37.19 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  32.56 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  35.25 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  32.58 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  32.81 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  32.58 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  31.82 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  42.71 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  34.96 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  32.31 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  36.89 
 
 		 161 aa  67  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  32.58 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  32.58 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  32.58 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  31.54 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  33.9 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  31.11 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  32.2 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  34.11 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  32.23 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  31.06 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  32.58 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  34.96 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  29.85 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  33.9 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  28.8 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  28.33 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  29.84 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  28.45 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  35.19 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  35.34 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  31.45 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  29.23 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  35.78 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  32.48 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  32.09 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  30.36 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1088  protein of unknown function UPF0047  28.24 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.977912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  33.04 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  29.66 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  32.17 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  27.59 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  30.66 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  32.79 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  33.06 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  33.07 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  34.4 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  31.45 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  32.76 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  33.85 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  33.6 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  33.85 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  31.71 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  30.53 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  28.8 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  34.62 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  35.54 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  29.45 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  28.57 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  29.37 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  28.24 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  29.92 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  29.75 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  35.54 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  35.54 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  27.48 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  32.8 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  31.09 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>