212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2870 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2870  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  265  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142366  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22490  conserved hypothetical protein TIGR00149  76.52 
 
 		 155 aa  217  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.282378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7042  protein of unknown function UPF0047  73.68 
 
 		 135 aa  198  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1363  protein of unknown function UPF0047  69.92 
 
 		 134 aa  187  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2358  hypothetical protein  69.17 
 
 		 135 aa  185  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0335235  normal  0.0190831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1646  protein of unknown function UPF0047  71.43 
 
 		 135 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314568  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1966  hypothetical protein  63.16 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387815  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3612  hypothetical protein  62.88 
 
 		 134 aa  172  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3372  hypothetical protein  62.12 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3395  hypothetical protein  63.36 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5843  protein of unknown function UPF0047  71.43 
 
 		 135 aa  168  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228828  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3056  hypothetical protein  71.97 
 
 		 134 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2945  protein of unknown function UPF0047  70.68 
 
 		 135 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1861  hypothetical protein  77.78 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0103013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10190  conserved hypothetical protein TIGR00149  71.64 
 
 		 136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2345  hypothetical protein  66.94 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.202939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2392  hypothetical protein  66.94 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2386  hypothetical protein  66.94 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12577  hypothetical protein  64.17 
 
 		 129 aa  153  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0908128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1034  hypothetical protein  59.09 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0183321 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2639  hypothetical protein  63.33 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3764  hypothetical protein  62.6 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.434678 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0880  protein of unknown function UPF0047  46.21 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0539  protein of unknown function UPF0047  50.83 
 
 		 157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  40.17 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  33.88 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  41.03 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  34.15 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  38.02 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  34.71 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  34.15 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  31.62 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  40.59 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  34.31 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  33.05 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  35.51 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  39.17 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  31.78 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  34.21 
 
 		 130 aa  67  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  36.28 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  38.26 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  35 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  34.17 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  30.65 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  31.45 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  35.29 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  32.58 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  32.48 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  28.95 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  32.46 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  36.43 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  32.79 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  30.77 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  32.54 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  32.81 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  30.51 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  36.84 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  33.91 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  34.62 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  32.76 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  30.08 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  36.97 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1335  hypothetical protein  33.61 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970106  decreased coverage  0.00476745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  38.21 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  32.79 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  37.82 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  28.45 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  27.19 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  32.52 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  34.88 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  36.67 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  27.78 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  31.03 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  34.68 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  34.11 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  34.43 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  28.95 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  32.77 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  43.01 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  28.33 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  31.25 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  34.41 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  35.51 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  43.01 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  43.01 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  30.89 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  34.35 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  30.83 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  32.74 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1088  protein of unknown function UPF0047  28.1 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.977912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  29.5 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  34.09 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  27.59 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  28.46 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  32.46 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  34.96 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>