209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10190 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_10190  conserved hypothetical protein TIGR00149  100 
 
 		 136 aa  272  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5843  protein of unknown function UPF0047  77.94 
 
 		 135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228828  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3395  hypothetical protein  64.93 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1363  protein of unknown function UPF0047  68.38 
 
 		 134 aa  184  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2358  hypothetical protein  68.15 
 
 		 135 aa  183  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0335235  normal  0.0190831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3612  hypothetical protein  66.91 
 
 		 134 aa  183  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22490  conserved hypothetical protein TIGR00149  66.91 
 
 		 155 aa  180  7e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.282378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1646  protein of unknown function UPF0047  68.38 
 
 		 135 aa  179  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3372  hypothetical protein  64.71 
 
 		 151 aa  177  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7042  protein of unknown function UPF0047  64.44 
 
 		 135 aa  177  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1034  hypothetical protein  63.97 
 
 		 133 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0183321 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1966  hypothetical protein  59.7 
 
 		 142 aa  166  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387815  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2345  hypothetical protein  61.48 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.202939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2392  hypothetical protein  61.48 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2386  hypothetical protein  61.48 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3764  hypothetical protein  57.97 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.434678 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2870  hypothetical protein  71.11 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142366  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2639  hypothetical protein  61.07 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12577  hypothetical protein  61.07 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0908128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0880  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 		 136 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2945  protein of unknown function UPF0047  63.7 
 
 		 135 aa  147  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3056  hypothetical protein  63.97 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0539  protein of unknown function UPF0047  51.11 
 
 		 157 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1861  hypothetical protein  65.65 
 
 		 129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0103013 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  34.31 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  31.78 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  35.56 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  34.59 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  33.59 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  33.86 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  34.35 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  28.68 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  33.05 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  33.07 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  31.03 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  26.52 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  34.33 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  34.78 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  32.28 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  29.32 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  27.27 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  28.24 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  36.75 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  32.28 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  31.01 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0889  protein of unknown function UPF0047  31.16 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0742  conserved hypothetical protein TIGR00149  31.16 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  33.85 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  29.01 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  31.97 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  29.77 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  34.07 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  27.82 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  33.59 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  27.27 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  29.03 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  38.46 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  38.46 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  27.78 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  26.87 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  30.47 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  35.34 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  33.08 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  37.69 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  30.15 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  28.23 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  29.71 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  28.91 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  30.65 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  29.6 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  26.4 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  39.67 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  31.2 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  33.93 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  30.08 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  31.9 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  31.2 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  25.18 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  24.79 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  34.45 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  25.6 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  28.69 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  30.08 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  25.9 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  31.11 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  25.93 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  31.39 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  26.47 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  33.86 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0643  protein of unknown function UPF0047  33.87 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  32.58 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  32.59 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  28.57 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  23.88 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  30.4 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1542  protein of unknown function UPF0047  32.35 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  31.82 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>