210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1363 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1363  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 		 134 aa  269  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22490  conserved hypothetical protein TIGR00149  64.18 
 
 		 155 aa  181  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.282378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3612  hypothetical protein  63.43 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3372  hypothetical protein  63.43 
 
 		 151 aa  174  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3395  hypothetical protein  65.87 
 
 		 140 aa  173  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1646  protein of unknown function UPF0047  65.93 
 
 		 135 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314568  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2358  hypothetical protein  64.93 
 
 		 135 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0335235  normal  0.0190831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7042  protein of unknown function UPF0047  64.18 
 
 		 135 aa  171  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5843  protein of unknown function UPF0047  67.41 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228828  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1034  hypothetical protein  66.67 
 
 		 133 aa  166  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0183321 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1966  hypothetical protein  58.65 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387815  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10190  conserved hypothetical protein TIGR00149  68.38 
 
 		 136 aa  163  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2870  hypothetical protein  69.92 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142366  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0880  protein of unknown function UPF0047  53.79 
 
 		 136 aa  158  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2345  hypothetical protein  66.1 
 
 		 133 aa  157  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.202939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2392  hypothetical protein  66.1 
 
 		 133 aa  157  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2386  hypothetical protein  66.1 
 
 		 133 aa  157  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2945  protein of unknown function UPF0047  63.43 
 
 		 135 aa  154  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1861  hypothetical protein  68.75 
 
 		 129 aa  153  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0103013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2639  hypothetical protein  60.5 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12577  hypothetical protein  64.71 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0908128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3056  hypothetical protein  62.69 
 
 		 134 aa  146  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3764  hypothetical protein  57.02 
 
 		 136 aa  140  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.434678 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0539  protein of unknown function UPF0047  54.24 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  37.98 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  36.36 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  37.88 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  40.71 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  40.78 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  36.3 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  36.09 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  32.28 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  32.28 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  35 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  35.34 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  34.71 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  32.79 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  33.93 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  33.93 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  32.23 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  36.3 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  32.46 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  31.88 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  34.07 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  31.82 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  36.61 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  34.48 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  34.59 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  36.97 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  28.35 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  33.85 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  35.48 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  32.46 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  29.03 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  32.5 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  26.45 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4069  hypothetical protein  31.69 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491688  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  33.9 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  26.98 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  30.7 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  32.14 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  28.69 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0627  hypothetical protein  33.56 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  decreased coverage  0.00428994 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1124  hypothetical protein  34.91 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  29.46 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  33.93 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  32.23 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3983  hypothetical protein  32.23 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000552293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  36.79 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  31.71 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  32.48 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  32.26 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  31.82 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  29.51 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  26.92 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  32.2 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  29.27 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  35 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  29.57 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  31.3 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  32.03 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  31.03 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  26.5 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  27.34 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1335  hypothetical protein  33.06 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970106  decreased coverage  0.00476745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  32.17 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  27.19 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  26.32 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  28.23 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  31.3 
 
 		 160 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  28.33 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2219  hypothetical protein  33.06 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.457573 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  28.89 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  29.84 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1542  protein of unknown function UPF0047  34.31 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  28.95 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  29.84 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>