More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1825 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 		 141 aa  293  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  70.21 
 
 		 141 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  65.71 
 
 		 141 aa  207  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  63.12 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  65.25 
 
 		 141 aa  204  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  63.57 
 
 		 160 aa  196  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  64.29 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  62.86 
 
 		 140 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  63.57 
 
 		 142 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  65.19 
 
 		 148 aa  193  7e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  68.25 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  45.52 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  44.22 
 
 		 146 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  47.79 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  40.58 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  38.3 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  37.98 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  39.23 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  37.14 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  42.62 
 
 		 134 aa  98.2  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40920  predicted protein  37.86 
 
 		 184 aa  96.7  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  40.91 
 
 		 126 aa  89.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  42.4 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  37.4 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  33.82 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  35.04 
 
 		 133 aa  87.4  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  36.17 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39455  predicted protein  32.94 
 
 		 244 aa  87.4  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  34.81 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  32.35 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  37.72 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05951  hypothetical protein  36.22 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.517381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  35.61 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  35.83 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  36.3 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  38.46 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  40 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  35.71 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  35.51 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  34.19 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  35.25 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  33.08 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  29.93 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  31.85 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  39.66 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  39.2 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  33.61 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  31.5 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  36.07 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  35.54 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  35.82 
 
 		 138 aa  76.6  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  30.25 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  35 
 
 		 143 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  32.06 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  34.43 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  35.71 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  34.43 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  31.97 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  32.58 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  33.6 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  33.6 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  36.75 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  30.71 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  30.37 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  30.47 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  31.01 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  31.15 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  34.04 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  35.54 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  31.5 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  30.65 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  33.08 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  33.6 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  31.3 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  32.33 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  34.71 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  35.9 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  31.82 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  35.43 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  29.69 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  34.96 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.84 
 
 		 584 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  32.28 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  33.08 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1445  hypothetical protein  33.08 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0875053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  32.74 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  30.08 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  31.15 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  29.69 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  31.25 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2631  hypothetical protein  32.12 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  33.64 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  32.5 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2183  hypothetical protein  31.15 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  30.3 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>