219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39455 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_39455  predicted protein  100 
 
 
244 aa  501  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40920  predicted protein  44.38 
 
 
184 aa  141  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  40.12 
 
 
146 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  40.24 
 
 
145 aa  111  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  35.37 
 
 
145 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  39.02 
 
 
145 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  35.16 
 
 
141 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05951  hypothetical protein  33.52 
 
 
154 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.517381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  35.75 
 
 
141 aa  96.7  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  34.71 
 
 
141 aa  95.1  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  36.53 
 
 
142 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  31.18 
 
 
148 aa  89.4  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  33.94 
 
 
140 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  33.53 
 
 
160 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  33.53 
 
 
141 aa  87.8  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  32.94 
 
 
141 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  34.13 
 
 
142 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  31.98 
 
 
137 aa  81.3  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  30.95 
 
 
143 aa  78.2  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  29.34 
 
 
134 aa  77  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  30 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  28.08 
 
 
131 aa  74.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  31.21 
 
 
126 aa  72  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  29.01 
 
 
130 aa  71.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  26.67 
 
 
132 aa  70.5  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  29.19 
 
 
137 aa  67.8  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  31.51 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  28.83 
 
 
128 aa  63.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  28.07 
 
 
132 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  26.54 
 
 
135 aa  62.8  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  26.54 
 
 
135 aa  62.8  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  29.19 
 
 
161 aa  62.4  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  28.12 
 
 
138 aa  62  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  21.25 
 
 
138 aa  62  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  24.84 
 
 
132 aa  62  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  24.86 
 
 
132 aa  62  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  25.62 
 
 
139 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  26.45 
 
 
136 aa  61.2  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  23.46 
 
 
132 aa  61.6  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  25.81 
 
 
133 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  23.03 
 
 
130 aa  60.1  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  25.79 
 
 
139 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  25.62 
 
 
139 aa  59.7  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  25.32 
 
 
133 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  28.12 
 
 
134 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  27.33 
 
 
152 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  29.45 
 
 
139 aa  59.3  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  26.09 
 
 
130 aa  58.9  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2106  hypothetical protein  25.62 
 
 
138 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  27.04 
 
 
145 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0254  protein of unknown function UPF0047  22.42 
 
 
140 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3497  hypothetical protein  48 
 
 
137 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0304537  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  24.53 
 
 
137 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  26.83 
 
 
133 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  26.88 
 
 
137 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  22.75 
 
 
143 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  27.53 
 
 
161 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  21.88 
 
 
138 aa  57  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  24.18 
 
 
138 aa  57  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  24.43 
 
 
133 aa  56.6  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  21.88 
 
 
584 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  21.56 
 
 
136 aa  55.8  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  25.15 
 
 
132 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1152  hypothetical protein  25 
 
 
139 aa  55.8  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  28.86 
 
 
139 aa  55.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  24.73 
 
 
138 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  27.5 
 
 
132 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2363  hypothetical protein  23.64 
 
 
139 aa  55.1  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100491  normal  0.704799 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  25 
 
 
133 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  28.77 
 
 
139 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2666  protein of unknown function UPF0047  23.12 
 
 
138 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  25 
 
 
132 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  24.31 
 
 
136 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  25.29 
 
 
138 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1088  protein of unknown function UPF0047  25.47 
 
 
139 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.977912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  22.78 
 
 
133 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1739  protein of unknown function UPF0047  21.88 
 
 
138 aa  53.5  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 
139 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  22.5 
 
 
138 aa  53.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  21.25 
 
 
138 aa  53.1  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  26.14 
 
 
133 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  25.45 
 
 
131 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1344  hypothetical protein  22.5 
 
 
138 aa  53.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  23.57 
 
 
130 aa  52.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0225  hypothetical protein  21.69 
 
 
139 aa  52.4  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1966  hypothetical protein  26.51 
 
 
142 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387815  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  23.81 
 
 
140 aa  52.4  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  45.83 
 
 
139 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3095  hypothetical protein  25.16 
 
 
126 aa  52.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0121064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  21.25 
 
 
133 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3284  protein of unknown function UPF0047  23.75 
 
 
138 aa  52  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2631  hypothetical protein  21.56 
 
 
138 aa  52  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0225  hypothetical protein  21.69 
 
 
139 aa  52  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  23.75 
 
 
132 aa  52  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  22.02 
 
 
132 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0976  protein of unknown function UPF0047  23.12 
 
 
138 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.394936  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  45.83 
 
 
136 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  23.43 
 
 
132 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  26.62 
 
 
139 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  22.5 
 
 
132 aa  51.6  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>