298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1685 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 		 141 aa  297  3e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  66.43 
 
 		 141 aa  210  4.9999999999999996e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  65.71 
 
 		 141 aa  207  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  65.71 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  63.57 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  69.6 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  60.71 
 
 		 148 aa  188  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  60.28 
 
 		 160 aa  184  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  59.57 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  56.43 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  57.14 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  42.76 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  40.41 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  41.3 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  38.85 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  42.4 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40920  predicted protein  37.82 
 
 		 184 aa  101  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  35.46 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  36.88 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  34.75 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  41.22 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  42.4 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  35.43 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  36.96 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  33.58 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  33.08 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  35.82 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  39.52 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  33.8 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  34.81 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  34.09 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  39.26 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  35.11 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  33.08 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  35.43 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  32.61 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  36.72 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  34.38 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  31.3 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  32.8 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  36.29 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  32 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  32.12 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  37.01 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  32.58 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  32.85 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  32.59 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  35.94 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  30.88 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  33.58 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  31.2 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  32.56 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  30.83 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  31.11 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  31.85 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  32.37 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  34.4 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  33.61 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  36.03 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  31.03 
 
 		 132 aa  76.6  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  34.48 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  33.86 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  34.59 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  32.58 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  30.4 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  30.37 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05951  hypothetical protein  29.77 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.517381 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1445  hypothetical protein  33.1 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0875053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39455  predicted protein  30 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  33.08 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  28.23 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  34.43 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  35.25 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  35 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  31.58 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  34.92 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3072  hypothetical protein  32.85 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  32.39 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  32.23 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  32.23 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  36 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  34.43 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  28.68 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0111  hypothetical protein  35.04 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000308533 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  31.47 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  32.59 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  31.15 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  26.67 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  30.88 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  30.47 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3144  hypothetical protein  32.87 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  29.13 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  30.66 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  32.33 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  30.71 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  33.61 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  31.47 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>