More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2724 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  48.55 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  48.12 
 
 		 138 aa  134  5e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1088  protein of unknown function UPF0047  45.93 
 
 		 139 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.977912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  44.53 
 
 		 138 aa  120  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  43.48 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  42.24 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  42.22 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  37.59 
 
 		 136 aa  103  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  42.11 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  34.31 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  33.09 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  30.94 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  35.07 
 
 		 133 aa  83.6  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  35 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  31.85 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  39.32 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  35.11 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  35.48 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  31.54 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  28.26 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  38.52 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  31.4 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0632  hypothetical protein  29.29 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  30.71 
 
 		 140 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  34.17 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  35.48 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  34.59 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  35.48 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  33.81 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  34.96 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1956  hypothetical protein  30.65 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0266366  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  31.43 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  33.79 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  33.81 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  32.37 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  35.56 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  30.22 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  27.86 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  34.45 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  32.33 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  32.33 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  33.61 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  30.15 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  26.62 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  31.58 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  31.16 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  32.23 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  32.77 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  31.88 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  35.25 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  30.6 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  32.33 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  30.08 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  30.4 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  30.4 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3367  hypothetical protein  30.4 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00750068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  36.96 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  31.71 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  34.96 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  36.7 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  29.84 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  31.34 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  30.4 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  32.77 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  34.26 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  34.96 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  30.5 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  31.58 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  35.48 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1152  hypothetical protein  31.2 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  32.52 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  27.41 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5144  hypothetical protein  30.4 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356001  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2183  hypothetical protein  30.95 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  30.65 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0627  hypothetical protein  29.25 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  decreased coverage  0.00428994 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  31.67 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  31.71 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  30.6 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  28.77 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1124  hypothetical protein  26.87 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  31.4 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  29.45 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2889  hypothetical protein  29.6 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2386  hypothetical protein  31.71 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  27.74 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2345  hypothetical protein  31.71 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.202939  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  32.58 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2392  hypothetical protein  31.71 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0225  hypothetical protein  27.66 
 
 		 139 aa  67  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  31.45 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1335  hypothetical protein  29.84 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970106  decreased coverage  0.00476745 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  28.24 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3983  hypothetical protein  29.84 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000552293  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0225  hypothetical protein  26.95 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  33.06 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>