More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1728 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 		 141 aa  288  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  73.05 
 
 		 141 aa  216  7e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  65.96 
 
 		 141 aa  207  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  67.14 
 
 		 141 aa  206  7e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  68.89 
 
 		 141 aa  206  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  65.96 
 
 		 141 aa  201  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  65.25 
 
 		 148 aa  197  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  60.71 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  60 
 
 		 160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  58.57 
 
 		 140 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  59.29 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  43.84 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  43.45 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  42.07 
 
 		 145 aa  113  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  37.86 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40920  predicted protein  40.14 
 
 		 184 aa  103  9e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  43.2 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  40.69 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  34.29 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  35.66 
 
 		 131 aa  94.7  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  37.78 
 
 		 137 aa  94.4  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39455  predicted protein  32.96 
 
 		 244 aa  90.9  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  35.29 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  38.3 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  34.07 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  36.75 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  38.46 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  36.92 
 
 		 143 aa  87  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  35.71 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  38.02 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  34.09 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  36.59 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  42.86 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  34.88 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  43.97 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  34.31 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  37.93 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  32.59 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  36.67 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  34.38 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  35.34 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  35.56 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  34.15 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  33.61 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  38.24 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  35.11 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  34.38 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  36.28 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  36.22 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  34.27 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  38.71 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  38.64 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  35.34 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2363  hypothetical protein  33.58 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100491  normal  0.704799 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  36.84 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1191  hypothetical protein  32.85 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  30.37 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  34.31 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  37.19 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  33.58 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  36.67 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  34.71 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  37.1 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05951  hypothetical protein  33.81 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.517381 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  34.71 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  35.25 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  34.43 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  35.61 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3230  hypothetical protein  33.58 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  35.2 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  33.57 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  31.06 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  34.31 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1445  hypothetical protein  31.91 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0875053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  32.54 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  34.51 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3409  hypothetical protein  32.12 
 
 		 139 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000525529  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  38.71 
 
 		 139 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2666  protein of unknown function UPF0047  32.85 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0833  hypothetical protein  31.39 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  33.06 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0111  hypothetical protein  32.85 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000308533 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  36.21 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  32.54 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  35.25 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  31.39 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  35.54 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  33.08 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.85 
 
 		 584 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  36.59 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  36.59 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0920  protein of unknown function UPF0047  29.93 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0254  protein of unknown function UPF0047  32.61 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  35.25 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3634  protein of unknown function UPF0047  32.85 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>